Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
SMARCA2P51531 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
SMARCA2P51531 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
SMARCA2P51531 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
SMARCA2P51531 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
SMARCA2P51531 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
SMARCA2P51531 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.47■■■■□ 3.75
SMARCA2P51531 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
SMARCA2P51531 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
SMARCA2P51531 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
SMARCA2P51531 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC38.47■■■■□ 3.75
SMARCA2P51531 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC38.47■■■■□ 3.75
SMARCA2P51531 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
SMARCA2P51531 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC38.46■■■■□ 3.75
SMARCA2P51531 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
SMARCA2P51531 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
SMARCA2P51531 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC38.45■■■■□ 3.75
SMARCA2P51531 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC38.45■■■■□ 3.75
SMARCA2P51531 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
SMARCA2P51531 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
SMARCA2P51531 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
SMARCA2P51531 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.74
SMARCA2P51531 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
SMARCA2P51531 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
SMARCA2P51531 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC38.44■■■■□ 3.74
SMARCA2P51531 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC38.44■■■■□ 3.74
SMARCA2P51531 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
SMARCA2P51531 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
SMARCA2P51531 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
SMARCA2P51531 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC38.44■■■■□ 3.74
SMARCA2P51531 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC38.44■■■■□ 3.74
SMARCA2P51531 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
SMARCA2P51531 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC38.43■■■■□ 3.74
SMARCA2P51531 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
SMARCA2P51531 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
SMARCA2P51531 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
SMARCA2P51531 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
SMARCA2P51531 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
SMARCA2P51531 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
SMARCA2P51531 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
SMARCA2P51531 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
SMARCA2P51531 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC38.42■■■■□ 3.74
SMARCA2P51531 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC38.42■■■■□ 3.74
SMARCA2P51531 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
SMARCA2P51531 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
SMARCA2P51531 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
SMARCA2P51531 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
SMARCA2P51531 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
SMARCA2P51531 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC38.41■■■■□ 3.74
SMARCA2P51531 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
SMARCA2P51531 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
SMARCA2P51531 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
SMARCA2P51531 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
SMARCA2P51531 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
SMARCA2P51531 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
SMARCA2P51531 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
SMARCA2P51531 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
SMARCA2P51531 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
SMARCA2P51531 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
SMARCA2P51531 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
SMARCA2P51531 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
SMARCA2P51531 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
SMARCA2P51531 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
SMARCA2P51531 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC38.39■■■■□ 3.74
SMARCA2P51531 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.39■■■■□ 3.74
SMARCA2P51531 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
SMARCA2P51531 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
SMARCA2P51531 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
SMARCA2P51531 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC38.39■■■■□ 3.74
SMARCA2P51531 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
SMARCA2P51531 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC38.39■■■■□ 3.74
SMARCA2P51531 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
SMARCA2P51531 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
SMARCA2P51531 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC38.39■■■■□ 3.74
SMARCA2P51531 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC38.39■■■■□ 3.74
SMARCA2P51531 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC38.39■■■■□ 3.74
SMARCA2P51531 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC38.39■■■■□ 3.74
SMARCA2P51531 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
SMARCA2P51531 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
SMARCA2P51531 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.73
SMARCA2P51531 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
SMARCA2P51531 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
SMARCA2P51531 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC38.38■■■■□ 3.73
SMARCA2P51531 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
SMARCA2P51531 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC38.38■■■■□ 3.73
SMARCA2P51531 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
SMARCA2P51531 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
SMARCA2P51531 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
SMARCA2P51531 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
SMARCA2P51531 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
SMARCA2P51531 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC38.37■■■■□ 3.73
SMARCA2P51531 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
SMARCA2P51531 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC38.37■■■■□ 3.73
SMARCA2P51531 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC38.37■■■■□ 3.73
SMARCA2P51531 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
SMARCA2P51531 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
SMARCA2P51531 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
SMARCA2P51531 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC38.36■■■■□ 3.73
SMARCA2P51531 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
SMARCA2P51531 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms