Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERFP50548 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERFP50548 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERFP50548 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERFP50548 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERFP50548 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERFP50548 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERFP50548 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERFP50548 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERFP50548 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERFP50548 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERFP50548 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERFP50548 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERFP50548 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERFP50548 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ERFP50548 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERFP50548 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERFP50548 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERFP50548 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERFP50548 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERFP50548 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERFP50548 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERFP50548 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERFP50548 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERFP50548 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERFP50548 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERFP50548 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERFP50548 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERFP50548 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERFP50548 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERFP50548 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERFP50548 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERFP50548 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERFP50548 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERFP50548 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERFP50548 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERFP50548 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ERFP50548 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERFP50548 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERFP50548 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERFP50548 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ERFP50548 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERFP50548 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERFP50548 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERFP50548 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERFP50548 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERFP50548 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERFP50548 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERFP50548 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERFP50548 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERFP50548 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERFP50548 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERFP50548 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERFP50548 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERFP50548 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERFP50548 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERFP50548 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERFP50548 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERFP50548 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERFP50548 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ERFP50548 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERFP50548 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERFP50548 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERFP50548 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERFP50548 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERFP50548 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERFP50548 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERFP50548 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
ERFP50548 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERFP50548 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERFP50548 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERFP50548 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERFP50548 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERFP50548 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERFP50548 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERFP50548 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERFP50548 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERFP50548 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERFP50548 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERFP50548 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERFP50548 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERFP50548 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERFP50548 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERFP50548 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERFP50548 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERFP50548 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERFP50548 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERFP50548 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERFP50548 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERFP50548 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERFP50548 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERFP50548 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERFP50548 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERFP50548 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERFP50548 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERFP50548 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ERFP50548 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERFP50548 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERFP50548 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERFP50548 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms