Protein–RNA interactions for Protein: P50542

PEX5, Peroxisomal targeting signal 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX5P50542 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PEX5P50542 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PEX5P50542 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PEX5P50542 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PEX5P50542 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PEX5P50542 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PEX5P50542 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PEX5P50542 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PEX5P50542 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PEX5P50542 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PEX5P50542 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PEX5P50542 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PEX5P50542 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PEX5P50542 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PEX5P50542 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PEX5P50542 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PEX5P50542 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PEX5P50542 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PEX5P50542 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PEX5P50542 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PEX5P50542 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PEX5P50542 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PEX5P50542 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PEX5P50542 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PEX5P50542 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PEX5P50542 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PEX5P50542 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PEX5P50542 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PEX5P50542 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PEX5P50542 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PEX5P50542 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PEX5P50542 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX5P50542 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX5P50542 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX5P50542 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX5P50542 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX5P50542 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX5P50542 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX5P50542 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX5P50542 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX5P50542 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX5P50542 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX5P50542 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX5P50542 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX5P50542 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX5P50542 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX5P50542 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX5P50542 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX5P50542 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX5P50542 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX5P50542 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX5P50542 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PEX5P50542 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PEX5P50542 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PEX5P50542 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PEX5P50542 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PEX5P50542 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PEX5P50542 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PEX5P50542 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PEX5P50542 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PEX5P50542 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PEX5P50542 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PEX5P50542 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PEX5P50542 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PEX5P50542 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PEX5P50542 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PEX5P50542 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PEX5P50542 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PEX5P50542 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PEX5P50542 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PEX5P50542 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PEX5P50542 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PEX5P50542 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PEX5P50542 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PEX5P50542 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PEX5P50542 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PEX5P50542 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PEX5P50542 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PEX5P50542 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PEX5P50542 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PEX5P50542 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PEX5P50542 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PEX5P50542 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PEX5P50542 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PEX5P50542 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PEX5P50542 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PEX5P50542 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PEX5P50542 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PEX5P50542 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PEX5P50542 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PEX5P50542 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PEX5P50542 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PEX5P50542 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PEX5P50542 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PEX5P50542 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PEX5P50542 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PEX5P50542 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PEX5P50542 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PEX5P50542 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PEX5P50542 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms