Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
NUP153P49790 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
NUP153P49790 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
NUP153P49790 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC33.52■■■□□ 2.96
NUP153P49790 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC33.52■■■□□ 2.96
NUP153P49790 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
NUP153P49790 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
NUP153P49790 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
NUP153P49790 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
NUP153P49790 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC33.51■■■□□ 2.96
NUP153P49790 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.96
NUP153P49790 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
NUP153P49790 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC33.51■■■□□ 2.96
NUP153P49790 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
NUP153P49790 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
NUP153P49790 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
NUP153P49790 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
NUP153P49790 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
NUP153P49790 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
NUP153P49790 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
NUP153P49790 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
NUP153P49790 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
NUP153P49790 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
NUP153P49790 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
NUP153P49790 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
NUP153P49790 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
NUP153P49790 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
NUP153P49790 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
NUP153P49790 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC33.5■■■□□ 2.95
NUP153P49790 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
NUP153P49790 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
NUP153P49790 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
NUP153P49790 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
NUP153P49790 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
NUP153P49790 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
NUP153P49790 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
NUP153P49790 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
NUP153P49790 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
NUP153P49790 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
NUP153P49790 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
NUP153P49790 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
NUP153P49790 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
NUP153P49790 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
NUP153P49790 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
NUP153P49790 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
NUP153P49790 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
NUP153P49790 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
NUP153P49790 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
NUP153P49790 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
NUP153P49790 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
NUP153P49790 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
NUP153P49790 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
NUP153P49790 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
NUP153P49790 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
NUP153P49790 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
NUP153P49790 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
NUP153P49790 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
NUP153P49790 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
NUP153P49790 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
NUP153P49790 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
NUP153P49790 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
NUP153P49790 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
NUP153P49790 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
NUP153P49790 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
NUP153P49790 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
NUP153P49790 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
NUP153P49790 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
NUP153P49790 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
NUP153P49790 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
NUP153P49790 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
NUP153P49790 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
NUP153P49790 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
NUP153P49790 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
NUP153P49790 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
NUP153P49790 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
NUP153P49790 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
NUP153P49790 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
NUP153P49790 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
NUP153P49790 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
NUP153P49790 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
NUP153P49790 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC33.45■■■□□ 2.95
NUP153P49790 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
NUP153P49790 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
NUP153P49790 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
NUP153P49790 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
NUP153P49790 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
NUP153P49790 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
NUP153P49790 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
NUP153P49790 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
NUP153P49790 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
NUP153P49790 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
NUP153P49790 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
NUP153P49790 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
NUP153P49790 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
NUP153P49790 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
NUP153P49790 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.44■■■□□ 2.94
NUP153P49790 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
NUP153P49790 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
NUP153P49790 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
NUP153P49790 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms