Protein–RNA interactions for Protein: P49788

RARRES1, Retinoic acid receptor responder protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES1P49788 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RARRES1P49788 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RARRES1P49788 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RARRES1P49788 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RARRES1P49788 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RARRES1P49788 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RARRES1P49788 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RARRES1P49788 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RARRES1P49788 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RARRES1P49788 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RARRES1P49788 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RARRES1P49788 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RARRES1P49788 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RARRES1P49788 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RARRES1P49788 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RARRES1P49788 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RARRES1P49788 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RARRES1P49788 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RARRES1P49788 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RARRES1P49788 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RARRES1P49788 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RARRES1P49788 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RARRES1P49788 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RARRES1P49788 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RARRES1P49788 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RARRES1P49788 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RARRES1P49788 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RARRES1P49788 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RARRES1P49788 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RARRES1P49788 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RARRES1P49788 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RARRES1P49788 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RARRES1P49788 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RARRES1P49788 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RARRES1P49788 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RARRES1P49788 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RARRES1P49788 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RARRES1P49788 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RARRES1P49788 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RARRES1P49788 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RARRES1P49788 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RARRES1P49788 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RARRES1P49788 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RARRES1P49788 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RARRES1P49788 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RARRES1P49788 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RARRES1P49788 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RARRES1P49788 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RARRES1P49788 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RARRES1P49788 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RARRES1P49788 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RARRES1P49788 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RARRES1P49788 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RARRES1P49788 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RARRES1P49788 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RARRES1P49788 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RARRES1P49788 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RARRES1P49788 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RARRES1P49788 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RARRES1P49788 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RARRES1P49788 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RARRES1P49788 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RARRES1P49788 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RARRES1P49788 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RARRES1P49788 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RARRES1P49788 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RARRES1P49788 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RARRES1P49788 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RARRES1P49788 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RARRES1P49788 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RARRES1P49788 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RARRES1P49788 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RARRES1P49788 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RARRES1P49788 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RARRES1P49788 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RARRES1P49788 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RARRES1P49788 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RARRES1P49788 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RARRES1P49788 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RARRES1P49788 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RARRES1P49788 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RARRES1P49788 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RARRES1P49788 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RARRES1P49788 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RARRES1P49788 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RARRES1P49788 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RARRES1P49788 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RARRES1P49788 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RARRES1P49788 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RARRES1P49788 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RARRES1P49788 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RARRES1P49788 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RARRES1P49788 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RARRES1P49788 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RARRES1P49788 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RARRES1P49788 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RARRES1P49788 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RARRES1P49788 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RARRES1P49788 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RARRES1P49788 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms