Protein–RNA interactions for Protein: P49765

VEGFB, Vascular endothelial growth factor B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFBP49765 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VEGFBP49765 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
VEGFBP49765 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VEGFBP49765 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VEGFBP49765 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
VEGFBP49765 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
VEGFBP49765 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VEGFBP49765 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VEGFBP49765 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VEGFBP49765 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VEGFBP49765 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VEGFBP49765 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VEGFBP49765 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VEGFBP49765 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VEGFBP49765 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
VEGFBP49765 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
VEGFBP49765 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25■■□□□ 1.59
VEGFBP49765 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25■■□□□ 1.59
VEGFBP49765 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VEGFBP49765 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VEGFBP49765 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VEGFBP49765 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VEGFBP49765 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
VEGFBP49765 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VEGFBP49765 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VEGFBP49765 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VEGFBP49765 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VEGFBP49765 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VEGFBP49765 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
VEGFBP49765 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VEGFBP49765 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VEGFBP49765 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
VEGFBP49765 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VEGFBP49765 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
VEGFBP49765 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VEGFBP49765 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VEGFBP49765 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VEGFBP49765 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VEGFBP49765 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VEGFBP49765 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VEGFBP49765 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VEGFBP49765 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VEGFBP49765 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VEGFBP49765 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VEGFBP49765 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VEGFBP49765 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VEGFBP49765 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VEGFBP49765 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VEGFBP49765 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VEGFBP49765 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VEGFBP49765 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VEGFBP49765 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VEGFBP49765 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VEGFBP49765 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VEGFBP49765 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VEGFBP49765 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VEGFBP49765 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VEGFBP49765 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VEGFBP49765 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VEGFBP49765 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VEGFBP49765 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VEGFBP49765 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VEGFBP49765 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VEGFBP49765 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VEGFBP49765 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VEGFBP49765 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VEGFBP49765 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VEGFBP49765 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VEGFBP49765 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VEGFBP49765 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VEGFBP49765 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VEGFBP49765 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VEGFBP49765 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
VEGFBP49765 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VEGFBP49765 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VEGFBP49765 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VEGFBP49765 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VEGFBP49765 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VEGFBP49765 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VEGFBP49765 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VEGFBP49765 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VEGFBP49765 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VEGFBP49765 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VEGFBP49765 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VEGFBP49765 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VEGFBP49765 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VEGFBP49765 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VEGFBP49765 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VEGFBP49765 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VEGFBP49765 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VEGFBP49765 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VEGFBP49765 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VEGFBP49765 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VEGFBP49765 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VEGFBP49765 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VEGFBP49765 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
VEGFBP49765 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VEGFBP49765 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VEGFBP49765 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VEGFBP49765 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms