Protein–RNA interactions for Protein: P49757

NUMB, Protein numb homolog, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUMBP49757 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUMBP49757 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUMBP49757 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUMBP49757 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUMBP49757 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUMBP49757 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUMBP49757 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUMBP49757 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUMBP49757 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUMBP49757 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUMBP49757 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUMBP49757 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUMBP49757 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUMBP49757 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUMBP49757 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUMBP49757 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NUMBP49757 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUMBP49757 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUMBP49757 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUMBP49757 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUMBP49757 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUMBP49757 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUMBP49757 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUMBP49757 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUMBP49757 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUMBP49757 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUMBP49757 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NUMBP49757 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUMBP49757 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUMBP49757 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NUMBP49757 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUMBP49757 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NUMBP49757 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUMBP49757 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUMBP49757 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUMBP49757 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUMBP49757 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUMBP49757 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUMBP49757 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUMBP49757 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUMBP49757 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUMBP49757 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUMBP49757 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUMBP49757 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUMBP49757 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUMBP49757 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUMBP49757 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUMBP49757 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUMBP49757 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUMBP49757 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUMBP49757 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUMBP49757 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUMBP49757 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NUMBP49757 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUMBP49757 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUMBP49757 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUMBP49757 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUMBP49757 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NUMBP49757 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUMBP49757 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUMBP49757 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUMBP49757 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUMBP49757 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUMBP49757 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUMBP49757 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUMBP49757 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUMBP49757 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUMBP49757 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUMBP49757 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUMBP49757 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUMBP49757 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUMBP49757 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUMBP49757 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUMBP49757 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUMBP49757 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUMBP49757 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUMBP49757 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUMBP49757 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUMBP49757 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUMBP49757 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUMBP49757 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUMBP49757 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUMBP49757 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUMBP49757 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUMBP49757 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUMBP49757 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUMBP49757 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUMBP49757 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUMBP49757 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUMBP49757 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUMBP49757 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUMBP49757 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUMBP49757 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUMBP49757 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUMBP49757 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUMBP49757 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUMBP49757 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUMBP49757 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUMBP49757 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUMBP49757 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms