Protein–RNA interactions for Protein: P49639

HOXA1, Homeobox protein Hox-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA1P49639 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXA1P49639 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA1P49639 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA1P49639 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA1P49639 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA1P49639 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA1P49639 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA1P49639 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA1P49639 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA1P49639 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA1P49639 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA1P49639 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA1P49639 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA1P49639 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA1P49639 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA1P49639 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA1P49639 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA1P49639 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA1P49639 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA1P49639 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA1P49639 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA1P49639 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA1P49639 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA1P49639 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA1P49639 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA1P49639 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA1P49639 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA1P49639 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA1P49639 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA1P49639 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA1P49639 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA1P49639 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA1P49639 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA1P49639 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA1P49639 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA1P49639 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA1P49639 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA1P49639 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA1P49639 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA1P49639 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA1P49639 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA1P49639 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA1P49639 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA1P49639 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA1P49639 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA1P49639 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA1P49639 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA1P49639 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA1P49639 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA1P49639 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA1P49639 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA1P49639 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA1P49639 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA1P49639 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA1P49639 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA1P49639 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA1P49639 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA1P49639 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA1P49639 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA1P49639 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA1P49639 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA1P49639 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA1P49639 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA1P49639 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA1P49639 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA1P49639 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA1P49639 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA1P49639 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA1P49639 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA1P49639 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA1P49639 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA1P49639 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA1P49639 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA1P49639 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA1P49639 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA1P49639 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA1P49639 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA1P49639 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA1P49639 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA1P49639 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA1P49639 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA1P49639 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA1P49639 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA1P49639 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA1P49639 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA1P49639 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA1P49639 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA1P49639 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA1P49639 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA1P49639 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA1P49639 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA1P49639 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA1P49639 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA1P49639 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA1P49639 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA1P49639 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA1P49639 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA1P49639 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA1P49639 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA1P49639 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms