Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TTPAP49638 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TTPAP49638 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TTPAP49638 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TTPAP49638 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TTPAP49638 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TTPAP49638 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TTPAP49638 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TTPAP49638 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TTPAP49638 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TTPAP49638 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TTPAP49638 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TTPAP49638 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TTPAP49638 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TTPAP49638 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TTPAP49638 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TTPAP49638 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TTPAP49638 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TTPAP49638 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TTPAP49638 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TTPAP49638 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TTPAP49638 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TTPAP49638 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TTPAP49638 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TTPAP49638 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TTPAP49638 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TTPAP49638 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TTPAP49638 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TTPAP49638 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TTPAP49638 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TTPAP49638 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TTPAP49638 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TTPAP49638 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TTPAP49638 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TTPAP49638 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TTPAP49638 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TTPAP49638 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TTPAP49638 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TTPAP49638 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TTPAP49638 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TTPAP49638 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TTPAP49638 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TTPAP49638 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TTPAP49638 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TTPAP49638 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TTPAP49638 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TTPAP49638 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TTPAP49638 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TTPAP49638 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TTPAP49638 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TTPAP49638 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TTPAP49638 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TTPAP49638 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TTPAP49638 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TTPAP49638 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TTPAP49638 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TTPAP49638 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TTPAP49638 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TTPAP49638 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TTPAP49638 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TTPAP49638 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TTPAP49638 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TTPAP49638 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TTPAP49638 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TTPAP49638 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TTPAP49638 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TTPAP49638 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TTPAP49638 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TTPAP49638 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TTPAP49638 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TTPAP49638 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TTPAP49638 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TTPAP49638 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTPAP49638 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTPAP49638 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTPAP49638 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TTPAP49638 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTPAP49638 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTPAP49638 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTPAP49638 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTPAP49638 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTPAP49638 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTPAP49638 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TTPAP49638 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTPAP49638 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTPAP49638 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TTPAP49638 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TTPAP49638 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TTPAP49638 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TTPAP49638 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TTPAP49638 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TTPAP49638 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TTPAP49638 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TTPAP49638 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TTPAP49638 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TTPAP49638 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTPAP49638 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTPAP49638 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTPAP49638 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTPAP49638 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
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