Protein–RNA interactions for Protein: P48645

NMU, Neuromedin-U, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMUP48645 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NMUP48645 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NMUP48645 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NMUP48645 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NMUP48645 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NMUP48645 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NMUP48645 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NMUP48645 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NMUP48645 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NMUP48645 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NMUP48645 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NMUP48645 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NMUP48645 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMUP48645 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMUP48645 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMUP48645 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMUP48645 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMUP48645 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMUP48645 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMUP48645 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMUP48645 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMUP48645 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMUP48645 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMUP48645 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMUP48645 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMUP48645 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMUP48645 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMUP48645 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMUP48645 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMUP48645 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMUP48645 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NMUP48645 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NMUP48645 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NMUP48645 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NMUP48645 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NMUP48645 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NMUP48645 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NMUP48645 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
NMUP48645 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMUP48645 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMUP48645 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMUP48645 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMUP48645 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMUP48645 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMUP48645 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMUP48645 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMUP48645 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMUP48645 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMUP48645 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMUP48645 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMUP48645 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMUP48645 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMUP48645 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMUP48645 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMUP48645 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMUP48645 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMUP48645 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMUP48645 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMUP48645 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMUP48645 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMUP48645 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMUP48645 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMUP48645 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMUP48645 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NMUP48645 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMUP48645 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMUP48645 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMUP48645 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMUP48645 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMUP48645 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMUP48645 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMUP48645 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMUP48645 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMUP48645 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NMUP48645 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMUP48645 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMUP48645 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMUP48645 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMUP48645 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMUP48645 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMUP48645 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMUP48645 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMUP48645 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMUP48645 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMUP48645 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMUP48645 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMUP48645 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMUP48645 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMUP48645 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMUP48645 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMUP48645 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMUP48645 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMUP48645 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMUP48645 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NMUP48645 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMUP48645 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMUP48645 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMUP48645 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NMUP48645 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMUP48645 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms