Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
UTRNP46939 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
UTRNP46939 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
UTRNP46939 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
UTRNP46939 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
UTRNP46939 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
UTRNP46939 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
UTRNP46939 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
UTRNP46939 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
UTRNP46939 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
UTRNP46939 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
UTRNP46939 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
UTRNP46939 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
UTRNP46939 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
UTRNP46939 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
UTRNP46939 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
UTRNP46939 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
UTRNP46939 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
UTRNP46939 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
UTRNP46939 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.84
UTRNP46939 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.84
UTRNP46939 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
UTRNP46939 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
UTRNP46939 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
UTRNP46939 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
UTRNP46939 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
UTRNP46939 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
UTRNP46939 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
UTRNP46939 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
UTRNP46939 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
UTRNP46939 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
UTRNP46939 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
UTRNP46939 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
UTRNP46939 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
UTRNP46939 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
UTRNP46939 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
UTRNP46939 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
UTRNP46939 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
UTRNP46939 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
UTRNP46939 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
UTRNP46939 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
UTRNP46939 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
UTRNP46939 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
UTRNP46939 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
UTRNP46939 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
UTRNP46939 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
UTRNP46939 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
UTRNP46939 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
UTRNP46939 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
UTRNP46939 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
UTRNP46939 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
UTRNP46939 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
UTRNP46939 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
UTRNP46939 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
UTRNP46939 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
UTRNP46939 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
UTRNP46939 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
UTRNP46939 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
UTRNP46939 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
UTRNP46939 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
UTRNP46939 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
UTRNP46939 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
UTRNP46939 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
UTRNP46939 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
UTRNP46939 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
UTRNP46939 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
UTRNP46939 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
UTRNP46939 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
UTRNP46939 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
UTRNP46939 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
UTRNP46939 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
UTRNP46939 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
UTRNP46939 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
UTRNP46939 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
UTRNP46939 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
UTRNP46939 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
UTRNP46939 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
UTRNP46939 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
UTRNP46939 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
UTRNP46939 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
UTRNP46939 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
UTRNP46939 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
UTRNP46939 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
UTRNP46939 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
UTRNP46939 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
UTRNP46939 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.51■■□□□ 1.84
UTRNP46939 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
UTRNP46939 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
UTRNP46939 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
UTRNP46939 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
UTRNP46939 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
UTRNP46939 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
UTRNP46939 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
UTRNP46939 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
UTRNP46939 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
UTRNP46939 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
UTRNP46939 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
UTRNP46939 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
UTRNP46939 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
UTRNP46939 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms