Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDKN1BP46527 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms