Protein–RNA interactions for Protein: P45452

MMP13, Collagenase 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP13P45452 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP13P45452 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP13P45452 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP13P45452 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP13P45452 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP13P45452 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP13P45452 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP13P45452 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP13P45452 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP13P45452 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP13P45452 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP13P45452 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP13P45452 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP13P45452 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP13P45452 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP13P45452 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP13P45452 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP13P45452 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MMP13P45452 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MMP13P45452 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MMP13P45452 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MMP13P45452 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MMP13P45452 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP13P45452 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP13P45452 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP13P45452 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP13P45452 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP13P45452 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP13P45452 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP13P45452 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP13P45452 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP13P45452 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP13P45452 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP13P45452 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP13P45452 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP13P45452 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP13P45452 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP13P45452 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP13P45452 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP13P45452 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP13P45452 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP13P45452 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP13P45452 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP13P45452 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MMP13P45452 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MMP13P45452 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MMP13P45452 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MMP13P45452 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MMP13P45452 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MMP13P45452 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MMP13P45452 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MMP13P45452 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MMP13P45452 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MMP13P45452 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MMP13P45452 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MMP13P45452 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MMP13P45452 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MMP13P45452 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MMP13P45452 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MMP13P45452 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MMP13P45452 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MMP13P45452 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MMP13P45452 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MMP13P45452 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MMP13P45452 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MMP13P45452 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MMP13P45452 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MMP13P45452 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MMP13P45452 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MMP13P45452 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MMP13P45452 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MMP13P45452 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MMP13P45452 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MMP13P45452 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MMP13P45452 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MMP13P45452 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MMP13P45452 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MMP13P45452 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MMP13P45452 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MMP13P45452 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MMP13P45452 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MMP13P45452 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP13P45452 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP13P45452 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP13P45452 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP13P45452 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP13P45452 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP13P45452 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP13P45452 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP13P45452 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP13P45452 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP13P45452 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP13P45452 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP13P45452 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP13P45452 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP13P45452 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP13P45452 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP13P45452 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP13P45452 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP13P45452 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms