Protein–RNA interactions for Protein: P43268

ETV4, ETS translocation variant 4, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV4P43268 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ETV4P43268 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ETV4P43268 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ETV4P43268 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ETV4P43268 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ETV4P43268 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ETV4P43268 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ETV4P43268 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ETV4P43268 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ETV4P43268 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ETV4P43268 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ETV4P43268 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ETV4P43268 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ETV4P43268 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ETV4P43268 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ETV4P43268 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ETV4P43268 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ETV4P43268 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ETV4P43268 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ETV4P43268 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ETV4P43268 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ETV4P43268 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ETV4P43268 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ETV4P43268 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ETV4P43268 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ETV4P43268 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ETV4P43268 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ETV4P43268 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ETV4P43268 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ETV4P43268 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ETV4P43268 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ETV4P43268 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ETV4P43268 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ETV4P43268 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ETV4P43268 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ETV4P43268 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ETV4P43268 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ETV4P43268 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ETV4P43268 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ETV4P43268 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ETV4P43268 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ETV4P43268 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ETV4P43268 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ETV4P43268 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ETV4P43268 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ETV4P43268 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ETV4P43268 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ETV4P43268 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ETV4P43268 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ETV4P43268 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ETV4P43268 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ETV4P43268 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ETV4P43268 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ETV4P43268 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ETV4P43268 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ETV4P43268 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ETV4P43268 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ETV4P43268 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ETV4P43268 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ETV4P43268 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ETV4P43268 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ETV4P43268 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ETV4P43268 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ETV4P43268 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ETV4P43268 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ETV4P43268 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ETV4P43268 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ETV4P43268 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ETV4P43268 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ETV4P43268 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ETV4P43268 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ETV4P43268 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ETV4P43268 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ETV4P43268 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ETV4P43268 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ETV4P43268 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ETV4P43268 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ETV4P43268 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ETV4P43268 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ETV4P43268 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ETV4P43268 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ETV4P43268 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ETV4P43268 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ETV4P43268 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ETV4P43268 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ETV4P43268 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ETV4P43268 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ETV4P43268 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ETV4P43268 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ETV4P43268 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ETV4P43268 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ETV4P43268 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ETV4P43268 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ETV4P43268 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ETV4P43268 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ETV4P43268 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ETV4P43268 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ETV4P43268 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ETV4P43268 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ETV4P43268 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms