Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GRIA2P42262 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GRIA2P42262 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GRIA2P42262 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GRIA2P42262 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GRIA2P42262 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GRIA2P42262 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GRIA2P42262 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIA2P42262 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIA2P42262 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIA2P42262 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIA2P42262 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIA2P42262 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIA2P42262 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIA2P42262 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIA2P42262 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIA2P42262 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIA2P42262 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIA2P42262 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIA2P42262 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIA2P42262 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIA2P42262 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIA2P42262 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIA2P42262 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIA2P42262 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIA2P42262 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIA2P42262 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIA2P42262 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIA2P42262 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIA2P42262 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIA2P42262 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIA2P42262 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIA2P42262 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIA2P42262 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIA2P42262 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIA2P42262 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIA2P42262 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIA2P42262 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIA2P42262 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIA2P42262 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIA2P42262 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIA2P42262 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIA2P42262 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIA2P42262 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIA2P42262 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIA2P42262 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIA2P42262 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIA2P42262 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIA2P42262 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIA2P42262 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIA2P42262 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIA2P42262 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIA2P42262 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIA2P42262 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIA2P42262 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIA2P42262 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIA2P42262 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIA2P42262 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIA2P42262 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIA2P42262 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
GRIA2P42262 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIA2P42262 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIA2P42262 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIA2P42262 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIA2P42262 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIA2P42262 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIA2P42262 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIA2P42262 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIA2P42262 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIA2P42262 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIA2P42262 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIA2P42262 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIA2P42262 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIA2P42262 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIA2P42262 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIA2P42262 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIA2P42262 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIA2P42262 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIA2P42262 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIA2P42262 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIA2P42262 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIA2P42262 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIA2P42262 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIA2P42262 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIA2P42262 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIA2P42262 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIA2P42262 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIA2P42262 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIA2P42262 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIA2P42262 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIA2P42262 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIA2P42262 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIA2P42262 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIA2P42262 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIA2P42262 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIA2P42262 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIA2P42262 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRIA2P42262 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GRIA2P42262 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRIA2P42262 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms