Protein–RNA interactions for Protein: P41002

CCNF, Cyclin-F, humanhuman

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Length 786 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNFP41002 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNFP41002 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNFP41002 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNFP41002 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNFP41002 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNFP41002 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNFP41002 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNFP41002 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNFP41002 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNFP41002 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNFP41002 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNFP41002 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNFP41002 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNFP41002 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNFP41002 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNFP41002 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNFP41002 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNFP41002 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNFP41002 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNFP41002 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNFP41002 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNFP41002 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNFP41002 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNFP41002 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNFP41002 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNFP41002 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCNFP41002 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCNFP41002 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCNFP41002 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCNFP41002 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCNFP41002 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCNFP41002 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCNFP41002 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCNFP41002 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCNFP41002 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCNFP41002 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCNFP41002 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCNFP41002 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCNFP41002 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNFP41002 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNFP41002 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNFP41002 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNFP41002 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNFP41002 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNFP41002 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNFP41002 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNFP41002 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNFP41002 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNFP41002 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNFP41002 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNFP41002 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNFP41002 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNFP41002 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNFP41002 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNFP41002 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNFP41002 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNFP41002 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNFP41002 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNFP41002 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNFP41002 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNFP41002 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNFP41002 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNFP41002 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNFP41002 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCNFP41002 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCNFP41002 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCNFP41002 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCNFP41002 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCNFP41002 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCNFP41002 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCNFP41002 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCNFP41002 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCNFP41002 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCNFP41002 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCNFP41002 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCNFP41002 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCNFP41002 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCNFP41002 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNFP41002 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNFP41002 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNFP41002 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNFP41002 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNFP41002 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNFP41002 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNFP41002 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNFP41002 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNFP41002 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNFP41002 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNFP41002 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNFP41002 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNFP41002 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNFP41002 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNFP41002 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNFP41002 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNFP41002 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNFP41002 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNFP41002 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNFP41002 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNFP41002 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNFP41002 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
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