Protein–RNA interactions for Protein: P40937

RFC5, Replication factor C subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC5P40937 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFC5P40937 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFC5P40937 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFC5P40937 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFC5P40937 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFC5P40937 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFC5P40937 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFC5P40937 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RFC5P40937 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFC5P40937 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFC5P40937 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFC5P40937 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFC5P40937 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFC5P40937 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFC5P40937 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFC5P40937 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFC5P40937 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFC5P40937 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFC5P40937 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFC5P40937 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFC5P40937 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RFC5P40937 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFC5P40937 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFC5P40937 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFC5P40937 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RFC5P40937 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFC5P40937 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RFC5P40937 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFC5P40937 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFC5P40937 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFC5P40937 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFC5P40937 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFC5P40937 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFC5P40937 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFC5P40937 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFC5P40937 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFC5P40937 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFC5P40937 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFC5P40937 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFC5P40937 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFC5P40937 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RFC5P40937 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFC5P40937 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFC5P40937 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFC5P40937 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFC5P40937 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFC5P40937 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFC5P40937 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFC5P40937 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFC5P40937 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFC5P40937 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFC5P40937 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RFC5P40937 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RFC5P40937 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RFC5P40937 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RFC5P40937 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RFC5P40937 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RFC5P40937 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RFC5P40937 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RFC5P40937 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RFC5P40937 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RFC5P40937 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RFC5P40937 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RFC5P40937 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RFC5P40937 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RFC5P40937 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RFC5P40937 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RFC5P40937 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RFC5P40937 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RFC5P40937 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFC5P40937 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFC5P40937 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFC5P40937 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFC5P40937 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFC5P40937 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFC5P40937 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFC5P40937 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFC5P40937 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFC5P40937 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFC5P40937 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFC5P40937 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFC5P40937 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFC5P40937 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFC5P40937 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFC5P40937 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFC5P40937 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFC5P40937 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RFC5P40937 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFC5P40937 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFC5P40937 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFC5P40937 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFC5P40937 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFC5P40937 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFC5P40937 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFC5P40937 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFC5P40937 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFC5P40937 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFC5P40937 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFC5P40937 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RFC5P40937 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms