Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GGCXP38435 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GGCXP38435 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GGCXP38435 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GGCXP38435 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GGCXP38435 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GGCXP38435 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GGCXP38435 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GGCXP38435 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GGCXP38435 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GGCXP38435 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GGCXP38435 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GGCXP38435 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GGCXP38435 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GGCXP38435 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GGCXP38435 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GGCXP38435 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GGCXP38435 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GGCXP38435 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GGCXP38435 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GGCXP38435 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GGCXP38435 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GGCXP38435 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GGCXP38435 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GGCXP38435 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GGCXP38435 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GGCXP38435 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GGCXP38435 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GGCXP38435 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GGCXP38435 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GGCXP38435 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GGCXP38435 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GGCXP38435 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GGCXP38435 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GGCXP38435 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GGCXP38435 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GGCXP38435 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GGCXP38435 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GGCXP38435 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GGCXP38435 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GGCXP38435 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GGCXP38435 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GGCXP38435 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GGCXP38435 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GGCXP38435 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GGCXP38435 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GGCXP38435 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GGCXP38435 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GGCXP38435 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GGCXP38435 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GGCXP38435 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GGCXP38435 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GGCXP38435 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GGCXP38435 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GGCXP38435 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GGCXP38435 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GGCXP38435 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GGCXP38435 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GGCXP38435 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GGCXP38435 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GGCXP38435 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GGCXP38435 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GGCXP38435 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GGCXP38435 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GGCXP38435 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GGCXP38435 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GGCXP38435 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GGCXP38435 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GGCXP38435 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GGCXP38435 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GGCXP38435 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GGCXP38435 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GGCXP38435 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GGCXP38435 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GGCXP38435 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GGCXP38435 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GGCXP38435 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GGCXP38435 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GGCXP38435 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GGCXP38435 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GGCXP38435 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GGCXP38435 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GGCXP38435 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GGCXP38435 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GGCXP38435 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GGCXP38435 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GGCXP38435 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GGCXP38435 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GGCXP38435 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GGCXP38435 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GGCXP38435 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GGCXP38435 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GGCXP38435 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GGCXP38435 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GGCXP38435 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GGCXP38435 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GGCXP38435 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GGCXP38435 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GGCXP38435 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GGCXP38435 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms