Protein–RNA interactions for Protein: P38176

AVT5, Vacuolar amino acid transporter 5, yeastyeast

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVT5P38176 FIG1YBR040W 897 nt3.3□□□□□ -1.88
AVT5P38176 YBR238CYBR238C 2196 nt3.29□□□□□ -1.88
AVT5P38176 TPD3YAL016W 1908 nt3.29□□□□□ -1.88
AVT5P38176 ISW2YOR304W 3363 nt3.29□□□□□ -1.88
AVT5P38176 GRX3YDR098C 858 nt3.29□□□□□ -1.88
AVT5P38176 SEC53YFL045C 765 nt3.29□□□□□ -1.88
AVT5P38176 YGR115CYGR115C 780 nt3.29□□□□□ -1.88
AVT5P38176 GTR2YGR163W 1026 nt3.29□□□□□ -1.88
AVT5P38176 BUD19YJL188C 309 nt3.29□□□□□ -1.88
AVT5P38176 RPP0YLR340W 939 nt3.29□□□□□ -1.88
AVT5P38176 DLT1YMR126C 1029 nt3.29□□□□□ -1.88
AVT5P38176 USV1YPL230W 1176 nt3.29□□□□□ -1.88
AVT5P38176 TAF6YGL112C 1551 nt3.29□□□□□ -1.88
AVT5P38176 NTA1YJR062C 1374 nt3.28□□□□□ -1.88
AVT5P38176 HSP30YCR021C 999 nt3.28□□□□□ -1.88
AVT5P38176 ELO2YCR034W 1044 nt3.28□□□□□ -1.88
AVT5P38176 YCR075W-AYCR075W-A 228 nt3.28□□□□□ -1.88
AVT5P38176 YCR108CYCR108C 192 nt3.28□□□□□ -1.88
AVT5P38176 FCF1YDR339C 570 nt3.28□□□□□ -1.88
AVT5P38176 YEL053W-AYEL053W-A 348 nt3.28□□□□□ -1.88
AVT5P38176 TDA10YGR205W 873 nt3.28□□□□□ -1.88
AVT5P38176 tX(XXX)DtX(XXX)D 100 nt3.28□□□□□ -1.88
AVT5P38176 AUR1YKL004W 1206 nt3.28□□□□□ -1.88
AVT5P38176 YKL202WYKL202W 582 nt3.28□□□□□ -1.88
AVT5P38176 YLR217WYLR217W 324 nt3.28□□□□□ -1.88
AVT5P38176 YMR187CYMR187C 1296 nt3.28□□□□□ -1.88
AVT5P38176 GAL7YBR018C 1101 nt3.28□□□□□ -1.88
AVT5P38176 YOR263CYOR263C 408 nt3.28□□□□□ -1.88
AVT5P38176 PPT2YPL148C 522 nt3.28□□□□□ -1.88
AVT5P38176 POF1YCL047C 777 nt3.28□□□□□ -1.88
AVT5P38176 TAF8YML114C 1533 nt3.28□□□□□ -1.88
AVT5P38176 SLI1YGR212W 1407 nt3.27□□□□□ -1.89
AVT5P38176 TRM12YML005W 1389 nt3.27□□□□□ -1.89
AVT5P38176 SPC19YDR201W 498 nt3.27□□□□□ -1.89
AVT5P38176 MIG3YER028C 1185 nt3.27□□□□□ -1.89
AVT5P38176 YVH1YIR026C 1095 nt3.27□□□□□ -1.89
AVT5P38176 ACP1YKL192C 378 nt3.27□□□□□ -1.89
AVT5P38176 HMX1YLR205C 954 nt3.27□□□□□ -1.89
AVT5P38176 SGT1YOR057W 1188 nt3.27□□□□□ -1.89
AVT5P38176 SUR1YPL057C 1149 nt3.27□□□□□ -1.89
AVT5P38176 YBR096WYBR096W 693 nt3.27□□□□□ -1.89
AVT5P38176 SPC105YGL093W 2754 nt3.27□□□□□ -1.89
AVT5P38176 YDR131CYDR131C 1671 nt3.27□□□□□ -1.89
AVT5P38176 UTP25YIL091C 2166 nt3.27□□□□□ -1.89
AVT5P38176 TRS120YDR407C 3870 nt3.26□□□□□ -1.89
AVT5P38176 NUP159YIL115C 4383 nt3.26□□□□□ -1.89
AVT5P38176 EPO1YMR124W 2832 nt3.26□□□□□ -1.89
AVT5P38176 PLM2YDR501W 1566 nt3.26□□□□□ -1.89
AVT5P38176 VPS38YLR360W 1320 nt3.26□□□□□ -1.89
AVT5P38176 NHP10YDL002C 612 nt3.26□□□□□ -1.89
AVT5P38176 RPL13AYDL082W 600 nt3.26□□□□□ -1.89
AVT5P38176 MRPL11YDL202W 750 nt3.26□□□□□ -1.89
AVT5P38176 DPB4YDR121W 591 nt3.26□□□□□ -1.89
AVT5P38176 HOM2YDR158W 1098 nt3.26□□□□□ -1.89
AVT5P38176 YGL006W-AYGL006W-A 111 nt3.26□□□□□ -1.89
AVT5P38176 PGD1YGL025C 1194 nt3.26□□□□□ -1.89
AVT5P38176 SCM4YGR049W 564 nt3.26□□□□□ -1.89
AVT5P38176 REC104YHR157W 549 nt3.26□□□□□ -1.89
AVT5P38176 YHR214C-DYHR214C-D 294 nt3.26□□□□□ -1.89
AVT5P38176 PET130YJL023C 1044 nt3.26□□□□□ -1.89
AVT5P38176 CPR7YJR032W 1182 nt3.26□□□□□ -1.89
AVT5P38176 YAR069CYAR069C 294 nt3.26□□□□□ -1.89
AVT5P38176 ASC1YMR116C 960 nt3.26□□□□□ -1.89
AVT5P38176 SSO2YMR183C 888 nt3.26□□□□□ -1.89
AVT5P38176 NRK1YNL129W 723 nt3.26□□□□□ -1.89
AVT5P38176 DGA1YOR245C 1257 nt3.26□□□□□ -1.89
AVT5P38176 NAT1YDL040C 2565 nt3.26□□□□□ -1.89
AVT5P38176 AEP3YPL005W 1821 nt3.26□□□□□ -1.89
AVT5P38176 URA2YJL130C 6645 nt3.25□□□□□ -1.89
AVT5P38176 GCD1YOR260W 1737 nt3.25□□□□□ -1.89
AVT5P38176 GDH2YDL215C 3279 nt3.25□□□□□ -1.89
AVT5P38176 SST2YLR452C 2097 nt3.25□□□□□ -1.89
AVT5P38176 RVS161YCR009C 798 nt3.25□□□□□ -1.89
AVT5P38176 YDR248CYDR248C 582 nt3.25□□□□□ -1.89
AVT5P38176 YGL138CYGL138C 1038 nt3.25□□□□□ -1.89
AVT5P38176 YJR037WYJR037W 384 nt3.25□□□□□ -1.89
AVT5P38176 SWD2YKL018W 990 nt3.25□□□□□ -1.89
AVT5P38176 YNK1YKL067W 462 nt3.25□□□□□ -1.89
AVT5P38176 MOH1YBL049W 417 nt3.25□□□□□ -1.89
AVT5P38176 YNL035CYNL035C 1170 nt3.25□□□□□ -1.89
AVT5P38176 SIL1YOL031C 1266 nt3.25□□□□□ -1.89
AVT5P38176 YOR366WYOR366W 354 nt3.25□□□□□ -1.89
AVT5P38176 YBR071WYBR071W 636 nt3.25□□□□□ -1.89
AVT5P38176 POP7YBR167C 423 nt3.25□□□□□ -1.89
AVT5P38176 CIT1YNR001C 1440 nt3.25□□□□□ -1.89
AVT5P38176 SDS23YGL056C 1584 nt3.25□□□□□ -1.89
AVT5P38176 MSK1YNL073W 1731 nt3.24□□□□□ -1.89
AVT5P38176 UBX5YDR330W 1503 nt3.24□□□□□ -1.89
AVT5P38176 RSC58YLR033W 1509 nt3.24□□□□□ -1.89
AVT5P38176 ERG9YHR190W 1335 nt3.24□□□□□ -1.89
AVT5P38176 YDR535CYDR535C 501 nt3.24□□□□□ -1.89
AVT5P38176 BUD25YER014C-A 462 nt3.24□□□□□ -1.89
AVT5P38176 YER158W-AYER158W-A 216 nt3.24□□□□□ -1.89
AVT5P38176 YFL051CYFL051C 483 nt3.24□□□□□ -1.89
AVT5P38176 ECO1YFR027W 846 nt3.24□□□□□ -1.89
AVT5P38176 YGR026WYGR026W 837 nt3.24□□□□□ -1.89
AVT5P38176 YIL156W-AYIL156W-A 402 nt3.24□□□□□ -1.89
AVT5P38176 YJR157WYJR157W 363 nt3.24□□□□□ -1.89
AVT5P38176 GPX1YKL026C 504 nt3.24□□□□□ -1.89
AVT5P38176 YPT52YKR014C 705 nt3.24□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 26.1 ms