Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TGFBR1P36897 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms