Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHRNA7P36544 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms