Protein–RNA interactions for Protein: P35711

SOX5, Transcription factor SOX-5, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX5P35711 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOX5P35711 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOX5P35711 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOX5P35711 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOX5P35711 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOX5P35711 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SOX5P35711 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SOX5P35711 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SOX5P35711 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SOX5P35711 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SOX5P35711 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SOX5P35711 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SOX5P35711 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SOX5P35711 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SOX5P35711 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SOX5P35711 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SOX5P35711 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SOX5P35711 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SOX5P35711 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SOX5P35711 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SOX5P35711 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SOX5P35711 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SOX5P35711 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SOX5P35711 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SOX5P35711 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SOX5P35711 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SOX5P35711 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SOX5P35711 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SOX5P35711 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SOX5P35711 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SOX5P35711 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SOX5P35711 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SOX5P35711 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SOX5P35711 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOX5P35711 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOX5P35711 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOX5P35711 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOX5P35711 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOX5P35711 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SOX5P35711 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOX5P35711 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOX5P35711 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOX5P35711 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOX5P35711 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOX5P35711 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SOX5P35711 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SOX5P35711 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SOX5P35711 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SOX5P35711 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SOX5P35711 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SOX5P35711 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SOX5P35711 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SOX5P35711 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SOX5P35711 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SOX5P35711 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SOX5P35711 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOX5P35711 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOX5P35711 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SOX5P35711 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOX5P35711 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOX5P35711 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOX5P35711 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOX5P35711 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOX5P35711 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOX5P35711 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOX5P35711 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOX5P35711 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOX5P35711 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOX5P35711 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOX5P35711 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOX5P35711 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOX5P35711 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SOX5P35711 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOX5P35711 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOX5P35711 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOX5P35711 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOX5P35711 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOX5P35711 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SOX5P35711 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOX5P35711 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOX5P35711 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOX5P35711 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOX5P35711 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOX5P35711 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOX5P35711 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SOX5P35711 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SOX5P35711 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SOX5P35711 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SOX5P35711 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SOX5P35711 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SOX5P35711 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SOX5P35711 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SOX5P35711 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SOX5P35711 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SOX5P35711 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SOX5P35711 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SOX5P35711 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SOX5P35711 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SOX5P35711 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX5P35711 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms