Protein–RNA interactions for Protein: P35663

CYLC1, Cylicin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLC1P35663 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYLC1P35663 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYLC1P35663 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYLC1P35663 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYLC1P35663 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYLC1P35663 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CYLC1P35663 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYLC1P35663 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYLC1P35663 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYLC1P35663 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYLC1P35663 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYLC1P35663 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYLC1P35663 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYLC1P35663 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYLC1P35663 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CYLC1P35663 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYLC1P35663 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYLC1P35663 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYLC1P35663 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYLC1P35663 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CYLC1P35663 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYLC1P35663 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYLC1P35663 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYLC1P35663 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYLC1P35663 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYLC1P35663 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYLC1P35663 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYLC1P35663 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CYLC1P35663 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYLC1P35663 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYLC1P35663 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYLC1P35663 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYLC1P35663 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYLC1P35663 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYLC1P35663 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYLC1P35663 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYLC1P35663 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYLC1P35663 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYLC1P35663 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYLC1P35663 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CYLC1P35663 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CYLC1P35663 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYLC1P35663 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYLC1P35663 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYLC1P35663 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYLC1P35663 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYLC1P35663 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYLC1P35663 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYLC1P35663 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CYLC1P35663 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYLC1P35663 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CYLC1P35663 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYLC1P35663 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYLC1P35663 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYLC1P35663 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYLC1P35663 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYLC1P35663 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYLC1P35663 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYLC1P35663 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYLC1P35663 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYLC1P35663 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYLC1P35663 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYLC1P35663 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYLC1P35663 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYLC1P35663 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYLC1P35663 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYLC1P35663 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CYLC1P35663 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYLC1P35663 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYLC1P35663 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYLC1P35663 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYLC1P35663 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYLC1P35663 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYLC1P35663 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYLC1P35663 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYLC1P35663 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYLC1P35663 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYLC1P35663 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYLC1P35663 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYLC1P35663 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYLC1P35663 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYLC1P35663 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYLC1P35663 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYLC1P35663 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYLC1P35663 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYLC1P35663 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYLC1P35663 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYLC1P35663 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYLC1P35663 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYLC1P35663 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYLC1P35663 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYLC1P35663 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CYLC1P35663 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CYLC1P35663 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CYLC1P35663 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CYLC1P35663 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CYLC1P35663 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CYLC1P35663 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CYLC1P35663 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CYLC1P35663 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms