Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDIT3P35638 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDIT3P35638 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDIT3P35638 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDIT3P35638 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
DDIT3P35638 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDIT3P35638 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDIT3P35638 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDIT3P35638 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDIT3P35638 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDIT3P35638 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDIT3P35638 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDIT3P35638 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDIT3P35638 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDIT3P35638 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDIT3P35638 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDIT3P35638 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDIT3P35638 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDIT3P35638 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DDIT3P35638 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DDIT3P35638 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DDIT3P35638 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DDIT3P35638 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DDIT3P35638 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DDIT3P35638 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDIT3P35638 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDIT3P35638 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDIT3P35638 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDIT3P35638 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDIT3P35638 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDIT3P35638 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDIT3P35638 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDIT3P35638 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDIT3P35638 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDIT3P35638 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDIT3P35638 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
DDIT3P35638 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDIT3P35638 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDIT3P35638 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDIT3P35638 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDIT3P35638 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDIT3P35638 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDIT3P35638 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDIT3P35638 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
DDIT3P35638 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDIT3P35638 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDIT3P35638 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDIT3P35638 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DDIT3P35638 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DDIT3P35638 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DDIT3P35638 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DDIT3P35638 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DDIT3P35638 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DDIT3P35638 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DDIT3P35638 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DDIT3P35638 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDIT3P35638 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDIT3P35638 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDIT3P35638 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDIT3P35638 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDIT3P35638 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDIT3P35638 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDIT3P35638 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDIT3P35638 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDIT3P35638 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDIT3P35638 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDIT3P35638 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDIT3P35638 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDIT3P35638 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDIT3P35638 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDIT3P35638 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDIT3P35638 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
DDIT3P35638 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDIT3P35638 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDIT3P35638 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDIT3P35638 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDIT3P35638 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDIT3P35638 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDIT3P35638 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDIT3P35638 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDIT3P35638 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDIT3P35638 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDIT3P35638 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDIT3P35638 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDIT3P35638 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDIT3P35638 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDIT3P35638 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDIT3P35638 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDIT3P35638 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
DDIT3P35638 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDIT3P35638 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDIT3P35638 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDIT3P35638 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDIT3P35638 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDIT3P35638 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDIT3P35638 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDIT3P35638 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDIT3P35638 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDIT3P35638 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDIT3P35638 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms