Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTNNA1P35221 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTNNA1P35221 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTNNA1P35221 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTNNA1P35221 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTNNA1P35221 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CTNNA1P35221 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTNNA1P35221 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTNNA1P35221 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTNNA1P35221 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTNNA1P35221 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTNNA1P35221 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTNNA1P35221 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTNNA1P35221 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTNNA1P35221 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTNNA1P35221 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTNNA1P35221 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTNNA1P35221 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CTNNA1P35221 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTNNA1P35221 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTNNA1P35221 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTNNA1P35221 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTNNA1P35221 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTNNA1P35221 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTNNA1P35221 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTNNA1P35221 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTNNA1P35221 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTNNA1P35221 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTNNA1P35221 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTNNA1P35221 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTNNA1P35221 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTNNA1P35221 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTNNA1P35221 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTNNA1P35221 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTNNA1P35221 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CTNNA1P35221 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTNNA1P35221 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTNNA1P35221 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTNNA1P35221 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CTNNA1P35221 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTNNA1P35221 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTNNA1P35221 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CTNNA1P35221 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNNA1P35221 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNNA1P35221 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNNA1P35221 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNNA1P35221 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNNA1P35221 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNNA1P35221 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNNA1P35221 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNNA1P35221 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNNA1P35221 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNNA1P35221 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNNA1P35221 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNNA1P35221 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNNA1P35221 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNNA1P35221 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNNA1P35221 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNNA1P35221 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNNA1P35221 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTNNA1P35221 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTNNA1P35221 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTNNA1P35221 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CTNNA1P35221 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CTNNA1P35221 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTNNA1P35221 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTNNA1P35221 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTNNA1P35221 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CTNNA1P35221 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTNNA1P35221 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTNNA1P35221 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNNA1P35221 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNNA1P35221 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNNA1P35221 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNNA1P35221 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNNA1P35221 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNNA1P35221 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNNA1P35221 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNNA1P35221 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNNA1P35221 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNNA1P35221 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNNA1P35221 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNNA1P35221 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNNA1P35221 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNNA1P35221 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNNA1P35221 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNNA1P35221 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNNA1P35221 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNNA1P35221 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNNA1P35221 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNNA1P35221 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNNA1P35221 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNNA1P35221 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNNA1P35221 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNNA1P35221 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNNA1P35221 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNNA1P35221 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNNA1P35221 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNNA1P35221 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNNA1P35221 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms