Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJA4P35212 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJA4P35212 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJA4P35212 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
GJA4P35212 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJA4P35212 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJA4P35212 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
GJA4P35212 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJA4P35212 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
GJA4P35212 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJA4P35212 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJA4P35212 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJA4P35212 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJA4P35212 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJA4P35212 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJA4P35212 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJA4P35212 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJA4P35212 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJA4P35212 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJA4P35212 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJA4P35212 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJA4P35212 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJA4P35212 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJA4P35212 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJA4P35212 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
GJA4P35212 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJA4P35212 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJA4P35212 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJA4P35212 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJA4P35212 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJA4P35212 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJA4P35212 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJA4P35212 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJA4P35212 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJA4P35212 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJA4P35212 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJA4P35212 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJA4P35212 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJA4P35212 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJA4P35212 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJA4P35212 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJA4P35212 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJA4P35212 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJA4P35212 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJA4P35212 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJA4P35212 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GJA4P35212 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJA4P35212 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJA4P35212 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GJA4P35212 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJA4P35212 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJA4P35212 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJA4P35212 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJA4P35212 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJA4P35212 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJA4P35212 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJA4P35212 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJA4P35212 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJA4P35212 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GJA4P35212 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJA4P35212 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJA4P35212 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJA4P35212 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJA4P35212 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJA4P35212 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJA4P35212 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GJA4P35212 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJA4P35212 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJA4P35212 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJA4P35212 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJA4P35212 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJA4P35212 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJA4P35212 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJA4P35212 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJA4P35212 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJA4P35212 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJA4P35212 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJA4P35212 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJA4P35212 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJA4P35212 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJA4P35212 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJA4P35212 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJA4P35212 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GJA4P35212 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJA4P35212 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJA4P35212 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJA4P35212 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJA4P35212 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GJA4P35212 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJA4P35212 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJA4P35212 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GJA4P35212 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GJA4P35212 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJA4P35212 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJA4P35212 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJA4P35212 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJA4P35212 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJA4P35212 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJA4P35212 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJA4P35212 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms