Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPC1P35052 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPC1P35052 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPC1P35052 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPC1P35052 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPC1P35052 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPC1P35052 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPC1P35052 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPC1P35052 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPC1P35052 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPC1P35052 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPC1P35052 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPC1P35052 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPC1P35052 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPC1P35052 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPC1P35052 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPC1P35052 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPC1P35052 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPC1P35052 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPC1P35052 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPC1P35052 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPC1P35052 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPC1P35052 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPC1P35052 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPC1P35052 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPC1P35052 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPC1P35052 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPC1P35052 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPC1P35052 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPC1P35052 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPC1P35052 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPC1P35052 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPC1P35052 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPC1P35052 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GPC1P35052 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GPC1P35052 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPC1P35052 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPC1P35052 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPC1P35052 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPC1P35052 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPC1P35052 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPC1P35052 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPC1P35052 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPC1P35052 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPC1P35052 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPC1P35052 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPC1P35052 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPC1P35052 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPC1P35052 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPC1P35052 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GPC1P35052 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPC1P35052 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPC1P35052 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPC1P35052 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPC1P35052 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPC1P35052 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPC1P35052 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPC1P35052 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GPC1P35052 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPC1P35052 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPC1P35052 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPC1P35052 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPC1P35052 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPC1P35052 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GPC1P35052 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPC1P35052 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPC1P35052 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPC1P35052 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPC1P35052 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPC1P35052 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPC1P35052 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPC1P35052 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPC1P35052 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPC1P35052 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPC1P35052 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GPC1P35052 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPC1P35052 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPC1P35052 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPC1P35052 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPC1P35052 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPC1P35052 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPC1P35052 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPC1P35052 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPC1P35052 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPC1P35052 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPC1P35052 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPC1P35052 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPC1P35052 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GPC1P35052 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPC1P35052 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPC1P35052 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPC1P35052 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPC1P35052 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPC1P35052 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPC1P35052 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GPC1P35052 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
GPC1P35052 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
GPC1P35052 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GPC1P35052 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPC1P35052 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms