Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CHRNA3P32297 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CHRNA3P32297 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNA3P32297 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNA3P32297 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNA3P32297 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNA3P32297 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNA3P32297 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNA3P32297 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNA3P32297 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNA3P32297 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNA3P32297 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNA3P32297 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNA3P32297 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNA3P32297 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNA3P32297 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNA3P32297 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNA3P32297 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNA3P32297 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNA3P32297 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNA3P32297 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNA3P32297 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNA3P32297 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNA3P32297 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNA3P32297 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNA3P32297 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNA3P32297 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNA3P32297 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNA3P32297 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNA3P32297 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNA3P32297 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNA3P32297 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNA3P32297 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNA3P32297 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNA3P32297 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNA3P32297 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNA3P32297 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNA3P32297 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNA3P32297 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNA3P32297 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNA3P32297 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNA3P32297 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNA3P32297 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNA3P32297 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNA3P32297 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNA3P32297 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNA3P32297 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNA3P32297 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNA3P32297 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNA3P32297 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNA3P32297 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNA3P32297 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNA3P32297 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNA3P32297 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNA3P32297 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNA3P32297 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNA3P32297 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNA3P32297 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNA3P32297 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNA3P32297 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNA3P32297 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNA3P32297 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNA3P32297 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNA3P32297 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNA3P32297 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNA3P32297 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNA3P32297 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHRNA3P32297 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHRNA3P32297 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHRNA3P32297 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNA3P32297 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNA3P32297 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNA3P32297 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNA3P32297 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNA3P32297 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNA3P32297 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNA3P32297 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNA3P32297 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNA3P32297 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNA3P32297 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNA3P32297 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNA3P32297 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNA3P32297 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNA3P32297 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNA3P32297 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNA3P32297 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA3P32297 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA3P32297 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA3P32297 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA3P32297 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA3P32297 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA3P32297 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA3P32297 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA3P32297 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA3P32297 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA3P32297 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA3P32297 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA3P32297 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA3P32297 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA3P32297 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms