Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
OTX2P32243 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
OTX2P32243 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
OTX2P32243 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
OTX2P32243 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
OTX2P32243 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
OTX2P32243 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
OTX2P32243 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
OTX2P32243 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
OTX2P32243 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
OTX2P32243 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
OTX2P32243 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
OTX2P32243 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
OTX2P32243 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
OTX2P32243 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
OTX2P32243 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
OTX2P32243 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
OTX2P32243 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
OTX2P32243 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
OTX2P32243 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
OTX2P32243 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
OTX2P32243 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
OTX2P32243 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
OTX2P32243 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
OTX2P32243 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
OTX2P32243 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
OTX2P32243 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
OTX2P32243 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
OTX2P32243 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
OTX2P32243 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
OTX2P32243 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
OTX2P32243 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
OTX2P32243 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
OTX2P32243 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
OTX2P32243 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
OTX2P32243 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
OTX2P32243 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
OTX2P32243 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
OTX2P32243 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
OTX2P32243 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
OTX2P32243 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
OTX2P32243 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
OTX2P32243 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
OTX2P32243 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
OTX2P32243 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
OTX2P32243 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
OTX2P32243 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
OTX2P32243 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
OTX2P32243 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
OTX2P32243 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
OTX2P32243 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
OTX2P32243 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
OTX2P32243 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
OTX2P32243 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
OTX2P32243 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
OTX2P32243 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
OTX2P32243 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
OTX2P32243 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
OTX2P32243 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
OTX2P32243 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
OTX2P32243 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
OTX2P32243 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
OTX2P32243 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
OTX2P32243 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
OTX2P32243 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
OTX2P32243 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
OTX2P32243 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
OTX2P32243 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
OTX2P32243 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
OTX2P32243 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
OTX2P32243 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
OTX2P32243 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
OTX2P32243 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
OTX2P32243 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
OTX2P32243 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
OTX2P32243 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
OTX2P32243 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
OTX2P32243 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
OTX2P32243 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
OTX2P32243 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
OTX2P32243 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
OTX2P32243 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
OTX2P32243 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
OTX2P32243 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
OTX2P32243 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
OTX2P32243 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
OTX2P32243 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
OTX2P32243 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
OTX2P32243 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
OTX2P32243 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
OTX2P32243 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
OTX2P32243 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
OTX2P32243 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
OTX2P32243 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
OTX2P32243 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
OTX2P32243 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
OTX2P32243 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
OTX2P32243 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
OTX2P32243 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
OTX2P32243 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms