Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXA13P31271 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXA13P31271 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXA13P31271 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXA13P31271 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXA13P31271 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HOXA13P31271 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HOXA13P31271 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HOXA13P31271 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HOXA13P31271 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXA13P31271 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXA13P31271 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXA13P31271 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXA13P31271 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXA13P31271 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXA13P31271 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXA13P31271 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXA13P31271 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXA13P31271 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXA13P31271 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXA13P31271 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXA13P31271 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXA13P31271 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXA13P31271 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXA13P31271 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXA13P31271 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXA13P31271 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXA13P31271 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXA13P31271 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXA13P31271 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXA13P31271 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXA13P31271 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXA13P31271 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXA13P31271 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXA13P31271 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXA13P31271 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXA13P31271 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXA13P31271 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXA13P31271 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXA13P31271 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXA13P31271 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXA13P31271 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXA13P31271 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXA13P31271 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXA13P31271 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXA13P31271 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXA13P31271 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXA13P31271 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXA13P31271 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXA13P31271 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXA13P31271 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXA13P31271 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXA13P31271 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXA13P31271 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXA13P31271 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXA13P31271 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXA13P31271 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXA13P31271 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXA13P31271 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXA13P31271 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXA13P31271 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXA13P31271 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXA13P31271 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXA13P31271 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXA13P31271 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXA13P31271 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXA13P31271 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXA13P31271 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXA13P31271 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXA13P31271 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXA13P31271 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXA13P31271 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXA13P31271 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXA13P31271 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXA13P31271 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXA13P31271 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXA13P31271 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXA13P31271 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXA13P31271 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXA13P31271 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXA13P31271 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXA13P31271 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXA13P31271 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXA13P31271 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXA13P31271 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXA13P31271 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
HOXA13P31271 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HOXA13P31271 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXA13P31271 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXA13P31271 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXA13P31271 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXA13P31271 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXA13P31271 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXA13P31271 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXA13P31271 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXA13P31271 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXA13P31271 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXA13P31271 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXA13P31271 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXA13P31271 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms