Protein–RNA interactions for Protein: P30626

SRI, Sorcin, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRIP30626 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRIP30626 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRIP30626 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRIP30626 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRIP30626 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRIP30626 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRIP30626 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRIP30626 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRIP30626 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRIP30626 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRIP30626 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRIP30626 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRIP30626 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRIP30626 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRIP30626 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRIP30626 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRIP30626 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRIP30626 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRIP30626 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRIP30626 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRIP30626 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRIP30626 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRIP30626 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRIP30626 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRIP30626 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRIP30626 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRIP30626 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRIP30626 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRIP30626 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRIP30626 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRIP30626 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRIP30626 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRIP30626 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRIP30626 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRIP30626 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRIP30626 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRIP30626 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRIP30626 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRIP30626 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRIP30626 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRIP30626 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRIP30626 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRIP30626 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRIP30626 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRIP30626 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRIP30626 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRIP30626 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRIP30626 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRIP30626 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRIP30626 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRIP30626 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRIP30626 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRIP30626 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRIP30626 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRIP30626 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRIP30626 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRIP30626 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRIP30626 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRIP30626 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRIP30626 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRIP30626 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRIP30626 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRIP30626 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SRIP30626 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRIP30626 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRIP30626 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRIP30626 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRIP30626 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRIP30626 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRIP30626 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRIP30626 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRIP30626 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRIP30626 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRIP30626 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRIP30626 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRIP30626 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRIP30626 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRIP30626 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRIP30626 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRIP30626 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRIP30626 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRIP30626 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRIP30626 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRIP30626 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SRIP30626 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRIP30626 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRIP30626 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRIP30626 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRIP30626 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRIP30626 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRIP30626 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRIP30626 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRIP30626 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SRIP30626 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SRIP30626 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SRIP30626 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SRIP30626 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRIP30626 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRIP30626 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRIP30626 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms