Protein–RNA interactions for Protein: P30084

ECHS1, Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1P30084 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ECHS1P30084 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ECHS1P30084 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ECHS1P30084 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ECHS1P30084 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ECHS1P30084 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ECHS1P30084 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ECHS1P30084 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ECHS1P30084 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ECHS1P30084 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ECHS1P30084 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ECHS1P30084 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ECHS1P30084 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ECHS1P30084 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ECHS1P30084 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ECHS1P30084 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ECHS1P30084 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ECHS1P30084 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ECHS1P30084 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ECHS1P30084 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ECHS1P30084 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ECHS1P30084 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ECHS1P30084 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ECHS1P30084 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ECHS1P30084 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ECHS1P30084 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ECHS1P30084 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ECHS1P30084 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ECHS1P30084 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ECHS1P30084 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ECHS1P30084 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ECHS1P30084 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ECHS1P30084 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ECHS1P30084 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ECHS1P30084 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ECHS1P30084 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ECHS1P30084 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ECHS1P30084 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ECHS1P30084 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ECHS1P30084 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ECHS1P30084 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ECHS1P30084 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ECHS1P30084 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ECHS1P30084 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ECHS1P30084 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ECHS1P30084 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ECHS1P30084 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ECHS1P30084 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ECHS1P30084 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ECHS1P30084 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ECHS1P30084 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ECHS1P30084 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ECHS1P30084 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ECHS1P30084 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ECHS1P30084 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ECHS1P30084 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ECHS1P30084 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ECHS1P30084 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ECHS1P30084 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ECHS1P30084 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ECHS1P30084 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ECHS1P30084 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ECHS1P30084 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ECHS1P30084 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ECHS1P30084 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ECHS1P30084 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ECHS1P30084 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ECHS1P30084 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ECHS1P30084 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ECHS1P30084 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ECHS1P30084 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ECHS1P30084 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ECHS1P30084 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ECHS1P30084 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ECHS1P30084 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ECHS1P30084 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ECHS1P30084 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ECHS1P30084 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ECHS1P30084 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ECHS1P30084 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ECHS1P30084 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ECHS1P30084 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ECHS1P30084 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ECHS1P30084 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ECHS1P30084 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ECHS1P30084 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ECHS1P30084 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ECHS1P30084 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ECHS1P30084 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ECHS1P30084 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ECHS1P30084 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ECHS1P30084 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ECHS1P30084 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ECHS1P30084 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ECHS1P30084 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ECHS1P30084 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ECHS1P30084 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ECHS1P30084 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ECHS1P30084 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ECHS1P30084 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms