Protein–RNA interactions for Protein: P29323

EPHB2, Ephrin type-B receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB2P29323 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPHB2P29323 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPHB2P29323 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
EPHB2P29323 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPHB2P29323 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPHB2P29323 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPHB2P29323 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPHB2P29323 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPHB2P29323 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPHB2P29323 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPHB2P29323 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPHB2P29323 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPHB2P29323 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPHB2P29323 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPHB2P29323 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPHB2P29323 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPHB2P29323 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
EPHB2P29323 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPHB2P29323 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPHB2P29323 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPHB2P29323 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPHB2P29323 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
EPHB2P29323 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPHB2P29323 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHB2P29323 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHB2P29323 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHB2P29323 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHB2P29323 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHB2P29323 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHB2P29323 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHB2P29323 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHB2P29323 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHB2P29323 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHB2P29323 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHB2P29323 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHB2P29323 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHB2P29323 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHB2P29323 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHB2P29323 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHB2P29323 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHB2P29323 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHB2P29323 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHB2P29323 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHB2P29323 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHB2P29323 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHB2P29323 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHB2P29323 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHB2P29323 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHB2P29323 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHB2P29323 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHB2P29323 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHB2P29323 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHB2P29323 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHB2P29323 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHB2P29323 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHB2P29323 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHB2P29323 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHB2P29323 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHB2P29323 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHB2P29323 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHB2P29323 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHB2P29323 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHB2P29323 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHB2P29323 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHB2P29323 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHB2P29323 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHB2P29323 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHB2P29323 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHB2P29323 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHB2P29323 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHB2P29323 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHB2P29323 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHB2P29323 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHB2P29323 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHB2P29323 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHB2P29323 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHB2P29323 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHB2P29323 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHB2P29323 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHB2P29323 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHB2P29323 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHB2P29323 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHB2P29323 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHB2P29323 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EPHB2P29323 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EPHB2P29323 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EPHB2P29323 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EPHB2P29323 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPHB2P29323 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPHB2P29323 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPHB2P29323 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPHB2P29323 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPHB2P29323 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPHB2P29323 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPHB2P29323 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPHB2P29323 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPHB2P29323 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHB2P29323 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHB2P29323 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHB2P29323 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms