Protein–RNA interactions for Protein: P28908

TNFRSF8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF8P28908 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF8P28908 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF8P28908 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF8P28908 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFRSF8P28908 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms