Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HLA-DMAP28067 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms