Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
DNMT1P26358 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
DNMT1P26358 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
DNMT1P26358 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
DNMT1P26358 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
DNMT1P26358 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
DNMT1P26358 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
DNMT1P26358 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
DNMT1P26358 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC32.23■■■□□ 2.75
DNMT1P26358 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
DNMT1P26358 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
DNMT1P26358 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
DNMT1P26358 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
DNMT1P26358 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
DNMT1P26358 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
DNMT1P26358 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
DNMT1P26358 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
DNMT1P26358 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
DNMT1P26358 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
DNMT1P26358 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
DNMT1P26358 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
DNMT1P26358 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
DNMT1P26358 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
DNMT1P26358 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
DNMT1P26358 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
DNMT1P26358 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
DNMT1P26358 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
DNMT1P26358 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
DNMT1P26358 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
DNMT1P26358 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
DNMT1P26358 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
DNMT1P26358 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
DNMT1P26358 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
DNMT1P26358 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
DNMT1P26358 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
DNMT1P26358 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
DNMT1P26358 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
DNMT1P26358 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
DNMT1P26358 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
DNMT1P26358 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
DNMT1P26358 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
DNMT1P26358 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
DNMT1P26358 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
DNMT1P26358 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
DNMT1P26358 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
DNMT1P26358 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
DNMT1P26358 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
DNMT1P26358 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
DNMT1P26358 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
DNMT1P26358 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
DNMT1P26358 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
DNMT1P26358 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
DNMT1P26358 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
DNMT1P26358 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
DNMT1P26358 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
DNMT1P26358 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
DNMT1P26358 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
DNMT1P26358 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
DNMT1P26358 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
DNMT1P26358 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
DNMT1P26358 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
DNMT1P26358 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
DNMT1P26358 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
DNMT1P26358 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
DNMT1P26358 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
DNMT1P26358 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
DNMT1P26358 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
DNMT1P26358 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
DNMT1P26358 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
DNMT1P26358 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
DNMT1P26358 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
DNMT1P26358 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
DNMT1P26358 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
DNMT1P26358 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
DNMT1P26358 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
DNMT1P26358 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
DNMT1P26358 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
DNMT1P26358 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
DNMT1P26358 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
DNMT1P26358 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
DNMT1P26358 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
DNMT1P26358 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
DNMT1P26358 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
DNMT1P26358 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
DNMT1P26358 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
DNMT1P26358 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
DNMT1P26358 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC32.15■■■□□ 2.74
DNMT1P26358 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
DNMT1P26358 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
DNMT1P26358 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
DNMT1P26358 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
DNMT1P26358 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
DNMT1P26358 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
DNMT1P26358 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
DNMT1P26358 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
DNMT1P26358 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
DNMT1P26358 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
DNMT1P26358 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
DNMT1P26358 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
DNMT1P26358 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms