Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFKBIAP25963 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFKBIAP25963 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NFKBIAP25963 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFKBIAP25963 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFKBIAP25963 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFKBIAP25963 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFKBIAP25963 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFKBIAP25963 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NFKBIAP25963 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFKBIAP25963 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFKBIAP25963 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFKBIAP25963 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFKBIAP25963 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFKBIAP25963 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFKBIAP25963 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFKBIAP25963 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFKBIAP25963 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFKBIAP25963 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFKBIAP25963 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFKBIAP25963 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFKBIAP25963 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFKBIAP25963 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFKBIAP25963 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NFKBIAP25963 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFKBIAP25963 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFKBIAP25963 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFKBIAP25963 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFKBIAP25963 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFKBIAP25963 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFKBIAP25963 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFKBIAP25963 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NFKBIAP25963 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFKBIAP25963 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFKBIAP25963 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFKBIAP25963 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFKBIAP25963 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFKBIAP25963 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFKBIAP25963 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFKBIAP25963 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms