Protein–RNA interactions for Protein: P25205

MCM3, DNA replication licensing factor MCM3, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3P25205 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MCM3P25205 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCM3P25205 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCM3P25205 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCM3P25205 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCM3P25205 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCM3P25205 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCM3P25205 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCM3P25205 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCM3P25205 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCM3P25205 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCM3P25205 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCM3P25205 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCM3P25205 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCM3P25205 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCM3P25205 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCM3P25205 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCM3P25205 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCM3P25205 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCM3P25205 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCM3P25205 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCM3P25205 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCM3P25205 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCM3P25205 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCM3P25205 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCM3P25205 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCM3P25205 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCM3P25205 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCM3P25205 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCM3P25205 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCM3P25205 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCM3P25205 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCM3P25205 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCM3P25205 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCM3P25205 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCM3P25205 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCM3P25205 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCM3P25205 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MCM3P25205 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCM3P25205 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCM3P25205 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCM3P25205 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCM3P25205 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCM3P25205 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCM3P25205 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCM3P25205 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCM3P25205 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCM3P25205 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCM3P25205 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCM3P25205 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCM3P25205 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCM3P25205 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCM3P25205 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCM3P25205 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCM3P25205 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCM3P25205 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCM3P25205 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCM3P25205 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCM3P25205 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCM3P25205 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCM3P25205 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCM3P25205 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCM3P25205 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCM3P25205 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCM3P25205 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCM3P25205 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCM3P25205 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCM3P25205 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCM3P25205 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCM3P25205 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCM3P25205 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCM3P25205 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCM3P25205 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCM3P25205 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCM3P25205 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCM3P25205 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCM3P25205 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCM3P25205 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCM3P25205 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCM3P25205 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCM3P25205 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCM3P25205 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCM3P25205 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCM3P25205 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCM3P25205 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCM3P25205 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCM3P25205 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCM3P25205 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MCM3P25205 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MCM3P25205 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MCM3P25205 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCM3P25205 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCM3P25205 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MCM3P25205 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCM3P25205 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCM3P25205 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCM3P25205 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCM3P25205 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCM3P25205 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCM3P25205 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms