Protein–RNA interactions for Protein: P24468

NR2F2, COUP transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F2P24468 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NR2F2P24468 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NR2F2P24468 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NR2F2P24468 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NR2F2P24468 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NR2F2P24468 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NR2F2P24468 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NR2F2P24468 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NR2F2P24468 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NR2F2P24468 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NR2F2P24468 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NR2F2P24468 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NR2F2P24468 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NR2F2P24468 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NR2F2P24468 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NR2F2P24468 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NR2F2P24468 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NR2F2P24468 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NR2F2P24468 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NR2F2P24468 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NR2F2P24468 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NR2F2P24468 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NR2F2P24468 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NR2F2P24468 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NR2F2P24468 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NR2F2P24468 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NR2F2P24468 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NR2F2P24468 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NR2F2P24468 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NR2F2P24468 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NR2F2P24468 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NR2F2P24468 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NR2F2P24468 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NR2F2P24468 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NR2F2P24468 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NR2F2P24468 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NR2F2P24468 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NR2F2P24468 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NR2F2P24468 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NR2F2P24468 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NR2F2P24468 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NR2F2P24468 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NR2F2P24468 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NR2F2P24468 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NR2F2P24468 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NR2F2P24468 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NR2F2P24468 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NR2F2P24468 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NR2F2P24468 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NR2F2P24468 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NR2F2P24468 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NR2F2P24468 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NR2F2P24468 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NR2F2P24468 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NR2F2P24468 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NR2F2P24468 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NR2F2P24468 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NR2F2P24468 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NR2F2P24468 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NR2F2P24468 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NR2F2P24468 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NR2F2P24468 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NR2F2P24468 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NR2F2P24468 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NR2F2P24468 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NR2F2P24468 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NR2F2P24468 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NR2F2P24468 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NR2F2P24468 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NR2F2P24468 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NR2F2P24468 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NR2F2P24468 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NR2F2P24468 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NR2F2P24468 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NR2F2P24468 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NR2F2P24468 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NR2F2P24468 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NR2F2P24468 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NR2F2P24468 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NR2F2P24468 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NR2F2P24468 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NR2F2P24468 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NR2F2P24468 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NR2F2P24468 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NR2F2P24468 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NR2F2P24468 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NR2F2P24468 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NR2F2P24468 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NR2F2P24468 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NR2F2P24468 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NR2F2P24468 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NR2F2P24468 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NR2F2P24468 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NR2F2P24468 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NR2F2P24468 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NR2F2P24468 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NR2F2P24468 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NR2F2P24468 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NR2F2P24468 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NR2F2P24468 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms