Protein–RNA interactions for Protein: P22888

LHCGR, Lutropin-choriogonadotropic hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHCGRP22888 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LHCGRP22888 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LHCGRP22888 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LHCGRP22888 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LHCGRP22888 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LHCGRP22888 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LHCGRP22888 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LHCGRP22888 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LHCGRP22888 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LHCGRP22888 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LHCGRP22888 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LHCGRP22888 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LHCGRP22888 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LHCGRP22888 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LHCGRP22888 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LHCGRP22888 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LHCGRP22888 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LHCGRP22888 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LHCGRP22888 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LHCGRP22888 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LHCGRP22888 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LHCGRP22888 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LHCGRP22888 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LHCGRP22888 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LHCGRP22888 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LHCGRP22888 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LHCGRP22888 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LHCGRP22888 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LHCGRP22888 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LHCGRP22888 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LHCGRP22888 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LHCGRP22888 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LHCGRP22888 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LHCGRP22888 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LHCGRP22888 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LHCGRP22888 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LHCGRP22888 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LHCGRP22888 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
LHCGRP22888 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
LHCGRP22888 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.33■■□□□ 1
LHCGRP22888 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LHCGRP22888 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
LHCGRP22888 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LHCGRP22888 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LHCGRP22888 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LHCGRP22888 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LHCGRP22888 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LHCGRP22888 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LHCGRP22888 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LHCGRP22888 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LHCGRP22888 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
LHCGRP22888 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
LHCGRP22888 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LHCGRP22888 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LHCGRP22888 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
LHCGRP22888 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LHCGRP22888 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LHCGRP22888 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LHCGRP22888 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LHCGRP22888 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LHCGRP22888 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LHCGRP22888 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LHCGRP22888 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LHCGRP22888 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LHCGRP22888 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LHCGRP22888 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LHCGRP22888 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LHCGRP22888 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LHCGRP22888 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
LHCGRP22888 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LHCGRP22888 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LHCGRP22888 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LHCGRP22888 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LHCGRP22888 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LHCGRP22888 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LHCGRP22888 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
LHCGRP22888 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
LHCGRP22888 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LHCGRP22888 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LHCGRP22888 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
LHCGRP22888 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LHCGRP22888 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LHCGRP22888 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LHCGRP22888 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LHCGRP22888 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LHCGRP22888 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LHCGRP22888 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LHCGRP22888 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LHCGRP22888 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LHCGRP22888 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LHCGRP22888 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.29■■□□□ 1
LHCGRP22888 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LHCGRP22888 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
LHCGRP22888 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
LHCGRP22888 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LHCGRP22888 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LHCGRP22888 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LHCGRP22888 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LHCGRP22888 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LHCGRP22888 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms