Protein–RNA interactions for Protein: P22455

FGFR4, Fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4P22455 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FGFR4P22455 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FGFR4P22455 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FGFR4P22455 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FGFR4P22455 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FGFR4P22455 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FGFR4P22455 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
FGFR4P22455 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FGFR4P22455 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FGFR4P22455 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FGFR4P22455 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FGFR4P22455 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FGFR4P22455 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
FGFR4P22455 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
FGFR4P22455 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FGFR4P22455 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FGFR4P22455 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FGFR4P22455 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FGFR4P22455 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
FGFR4P22455 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FGFR4P22455 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FGFR4P22455 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FGFR4P22455 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FGFR4P22455 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FGFR4P22455 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FGFR4P22455 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FGFR4P22455 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FGFR4P22455 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FGFR4P22455 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FGFR4P22455 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FGFR4P22455 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FGFR4P22455 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FGFR4P22455 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FGFR4P22455 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
FGFR4P22455 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGFR4P22455 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGFR4P22455 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
FGFR4P22455 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGFR4P22455 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGFR4P22455 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGFR4P22455 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGFR4P22455 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGFR4P22455 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGFR4P22455 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
FGFR4P22455 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGFR4P22455 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGFR4P22455 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGFR4P22455 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGFR4P22455 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGFR4P22455 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FGFR4P22455 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FGFR4P22455 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FGFR4P22455 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FGFR4P22455 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FGFR4P22455 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FGFR4P22455 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FGFR4P22455 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FGFR4P22455 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FGFR4P22455 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FGFR4P22455 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FGFR4P22455 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FGFR4P22455 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FGFR4P22455 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FGFR4P22455 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FGFR4P22455 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FGFR4P22455 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGFR4P22455 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGFR4P22455 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGFR4P22455 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGFR4P22455 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
FGFR4P22455 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGFR4P22455 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGFR4P22455 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGFR4P22455 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGFR4P22455 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGFR4P22455 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGFR4P22455 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGFR4P22455 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGFR4P22455 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGFR4P22455 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGFR4P22455 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGFR4P22455 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGFR4P22455 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGFR4P22455 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGFR4P22455 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FGFR4P22455 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FGFR4P22455 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FGFR4P22455 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FGFR4P22455 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FGFR4P22455 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FGFR4P22455 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FGFR4P22455 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FGFR4P22455 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
FGFR4P22455 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
FGFR4P22455 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
FGFR4P22455 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FGFR4P22455 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FGFR4P22455 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FGFR4P22455 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FGFR4P22455 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms