Protein–RNA interactions for Protein: P21810

BGN, Biglycan, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BGNP21810 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BGNP21810 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BGNP21810 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BGNP21810 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BGNP21810 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BGNP21810 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BGNP21810 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BGNP21810 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BGNP21810 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BGNP21810 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BGNP21810 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
BGNP21810 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BGNP21810 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BGNP21810 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BGNP21810 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BGNP21810 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BGNP21810 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BGNP21810 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BGNP21810 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BGNP21810 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BGNP21810 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BGNP21810 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BGNP21810 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BGNP21810 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BGNP21810 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BGNP21810 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BGNP21810 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BGNP21810 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BGNP21810 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BGNP21810 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BGNP21810 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BGNP21810 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BGNP21810 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BGNP21810 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BGNP21810 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BGNP21810 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
BGNP21810 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
BGNP21810 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BGNP21810 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
BGNP21810 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BGNP21810 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
BGNP21810 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BGNP21810 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BGNP21810 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BGNP21810 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BGNP21810 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BGNP21810 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BGNP21810 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BGNP21810 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BGNP21810 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BGNP21810 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BGNP21810 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
BGNP21810 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
BGNP21810 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BGNP21810 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BGNP21810 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BGNP21810 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BGNP21810 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BGNP21810 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BGNP21810 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BGNP21810 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BGNP21810 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
BGNP21810 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BGNP21810 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BGNP21810 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BGNP21810 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BGNP21810 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BGNP21810 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BGNP21810 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BGNP21810 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BGNP21810 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BGNP21810 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BGNP21810 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BGNP21810 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BGNP21810 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BGNP21810 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BGNP21810 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BGNP21810 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BGNP21810 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
BGNP21810 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BGNP21810 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BGNP21810 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BGNP21810 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BGNP21810 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BGNP21810 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BGNP21810 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BGNP21810 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BGNP21810 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BGNP21810 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BGNP21810 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BGNP21810 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BGNP21810 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BGNP21810 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BGNP21810 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BGNP21810 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BGNP21810 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BGNP21810 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BGNP21810 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BGNP21810 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BGNP21810 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms