Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CCNA2P20248 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCNA2P20248 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCNA2P20248 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCNA2P20248 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCNA2P20248 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCNA2P20248 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCNA2P20248 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCNA2P20248 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCNA2P20248 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CCNA2P20248 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CCNA2P20248 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCNA2P20248 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCNA2P20248 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCNA2P20248 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCNA2P20248 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCNA2P20248 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCNA2P20248 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCNA2P20248 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCNA2P20248 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCNA2P20248 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCNA2P20248 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCNA2P20248 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCNA2P20248 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCNA2P20248 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCNA2P20248 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCNA2P20248 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCNA2P20248 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCNA2P20248 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCNA2P20248 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCNA2P20248 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCNA2P20248 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCNA2P20248 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCNA2P20248 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCNA2P20248 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCNA2P20248 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCNA2P20248 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCNA2P20248 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCNA2P20248 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCNA2P20248 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCNA2P20248 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCNA2P20248 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCNA2P20248 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CCNA2P20248 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCNA2P20248 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCNA2P20248 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCNA2P20248 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CCNA2P20248 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCNA2P20248 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCNA2P20248 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCNA2P20248 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCNA2P20248 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCNA2P20248 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCNA2P20248 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCNA2P20248 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCNA2P20248 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCNA2P20248 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCNA2P20248 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCNA2P20248 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCNA2P20248 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCNA2P20248 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCNA2P20248 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCNA2P20248 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CCNA2P20248 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCNA2P20248 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCNA2P20248 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCNA2P20248 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCNA2P20248 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCNA2P20248 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCNA2P20248 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CCNA2P20248 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCNA2P20248 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCNA2P20248 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCNA2P20248 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCNA2P20248 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CCNA2P20248 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCNA2P20248 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCNA2P20248 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCNA2P20248 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCNA2P20248 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCNA2P20248 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCNA2P20248 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCNA2P20248 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCNA2P20248 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCNA2P20248 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCNA2P20248 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CCNA2P20248 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCNA2P20248 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCNA2P20248 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCNA2P20248 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCNA2P20248 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CCNA2P20248 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCNA2P20248 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCNA2P20248 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCNA2P20248 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCNA2P20248 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCNA2P20248 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCNA2P20248 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCNA2P20248 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCNA2P20248 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms