Protein–RNA interactions for Protein: P19447

ERCC3, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPB subunit, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC3P19447 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERCC3P19447 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ERCC3P19447 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERCC3P19447 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERCC3P19447 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERCC3P19447 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERCC3P19447 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERCC3P19447 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERCC3P19447 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERCC3P19447 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERCC3P19447 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERCC3P19447 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERCC3P19447 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERCC3P19447 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERCC3P19447 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERCC3P19447 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERCC3P19447 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERCC3P19447 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERCC3P19447 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERCC3P19447 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERCC3P19447 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERCC3P19447 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERCC3P19447 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERCC3P19447 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERCC3P19447 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERCC3P19447 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERCC3P19447 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERCC3P19447 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERCC3P19447 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERCC3P19447 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERCC3P19447 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERCC3P19447 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERCC3P19447 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERCC3P19447 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERCC3P19447 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERCC3P19447 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ERCC3P19447 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERCC3P19447 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERCC3P19447 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERCC3P19447 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERCC3P19447 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERCC3P19447 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERCC3P19447 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERCC3P19447 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERCC3P19447 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERCC3P19447 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERCC3P19447 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERCC3P19447 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERCC3P19447 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERCC3P19447 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ERCC3P19447 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERCC3P19447 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERCC3P19447 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERCC3P19447 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERCC3P19447 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERCC3P19447 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERCC3P19447 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERCC3P19447 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERCC3P19447 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERCC3P19447 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERCC3P19447 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERCC3P19447 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERCC3P19447 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ERCC3P19447 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERCC3P19447 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ERCC3P19447 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ERCC3P19447 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERCC3P19447 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ERCC3P19447 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ERCC3P19447 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ERCC3P19447 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ERCC3P19447 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ERCC3P19447 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ERCC3P19447 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ERCC3P19447 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERCC3P19447 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERCC3P19447 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERCC3P19447 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERCC3P19447 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERCC3P19447 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERCC3P19447 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERCC3P19447 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERCC3P19447 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERCC3P19447 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERCC3P19447 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERCC3P19447 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERCC3P19447 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERCC3P19447 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERCC3P19447 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERCC3P19447 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERCC3P19447 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ERCC3P19447 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ERCC3P19447 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERCC3P19447 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERCC3P19447 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERCC3P19447 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERCC3P19447 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERCC3P19447 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERCC3P19447 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERCC3P19447 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms