Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRAP18433 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRAP18433 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRAP18433 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRAP18433 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRAP18433 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRAP18433 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRAP18433 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRAP18433 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRAP18433 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRAP18433 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRAP18433 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRAP18433 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRAP18433 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRAP18433 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRAP18433 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRAP18433 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRAP18433 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRAP18433 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRAP18433 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRAP18433 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRAP18433 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRAP18433 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRAP18433 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRAP18433 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRAP18433 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRAP18433 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRAP18433 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRAP18433 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRAP18433 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRAP18433 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRAP18433 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRAP18433 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRAP18433 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRAP18433 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRAP18433 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRAP18433 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRAP18433 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRAP18433 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRAP18433 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRAP18433 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRAP18433 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRAP18433 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRAP18433 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRAP18433 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRAP18433 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRAP18433 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRAP18433 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRAP18433 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRAP18433 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRAP18433 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRAP18433 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRAP18433 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRAP18433 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRAP18433 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRAP18433 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRAP18433 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRAP18433 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTPRAP18433 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTPRAP18433 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
PTPRAP18433 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTPRAP18433 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRAP18433 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRAP18433 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRAP18433 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRAP18433 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRAP18433 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRAP18433 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRAP18433 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRAP18433 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRAP18433 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRAP18433 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRAP18433 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRAP18433 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRAP18433 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRAP18433 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRAP18433 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRAP18433 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRAP18433 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRAP18433 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRAP18433 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRAP18433 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRAP18433 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRAP18433 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRAP18433 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRAP18433 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRAP18433 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRAP18433 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRAP18433 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRAP18433 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRAP18433 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRAP18433 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRAP18433 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRAP18433 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRAP18433 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRAP18433 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRAP18433 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRAP18433 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRAP18433 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRAP18433 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
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