Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EGR1P18146 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EGR1P18146 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EGR1P18146 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EGR1P18146 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EGR1P18146 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EGR1P18146 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
EGR1P18146 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
EGR1P18146 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EGR1P18146 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
EGR1P18146 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EGR1P18146 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EGR1P18146 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EGR1P18146 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EGR1P18146 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EGR1P18146 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EGR1P18146 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EGR1P18146 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EGR1P18146 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EGR1P18146 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
EGR1P18146 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EGR1P18146 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EGR1P18146 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EGR1P18146 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
EGR1P18146 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EGR1P18146 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EGR1P18146 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EGR1P18146 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EGR1P18146 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EGR1P18146 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EGR1P18146 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EGR1P18146 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EGR1P18146 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGR1P18146 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGR1P18146 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGR1P18146 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGR1P18146 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGR1P18146 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGR1P18146 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGR1P18146 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
EGR1P18146 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGR1P18146 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
EGR1P18146 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGR1P18146 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGR1P18146 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
EGR1P18146 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGR1P18146 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGR1P18146 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGR1P18146 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGR1P18146 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGR1P18146 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGR1P18146 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGR1P18146 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGR1P18146 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGR1P18146 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGR1P18146 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGR1P18146 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGR1P18146 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGR1P18146 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGR1P18146 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGR1P18146 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGR1P18146 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGR1P18146 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGR1P18146 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGR1P18146 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGR1P18146 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EGR1P18146 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EGR1P18146 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EGR1P18146 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EGR1P18146 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EGR1P18146 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EGR1P18146 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EGR1P18146 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EGR1P18146 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EGR1P18146 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EGR1P18146 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EGR1P18146 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EGR1P18146 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EGR1P18146 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EGR1P18146 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EGR1P18146 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EGR1P18146 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EGR1P18146 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EGR1P18146 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EGR1P18146 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EGR1P18146 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EGR1P18146 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EGR1P18146 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EGR1P18146 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EGR1P18146 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EGR1P18146 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EGR1P18146 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
EGR1P18146 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EGR1P18146 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EGR1P18146 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
EGR1P18146 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EGR1P18146 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
EGR1P18146 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
EGR1P18146 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EGR1P18146 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms