Protein–RNA interactions for Protein: P17948

FLT1, Vascular endothelial growth factor receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT1P17948 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FLT1P17948 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FLT1P17948 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FLT1P17948 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FLT1P17948 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
FLT1P17948 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FLT1P17948 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
FLT1P17948 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FLT1P17948 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FLT1P17948 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FLT1P17948 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FLT1P17948 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FLT1P17948 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FLT1P17948 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FLT1P17948 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FLT1P17948 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FLT1P17948 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FLT1P17948 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FLT1P17948 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FLT1P17948 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FLT1P17948 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FLT1P17948 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FLT1P17948 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FLT1P17948 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FLT1P17948 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FLT1P17948 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FLT1P17948 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FLT1P17948 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FLT1P17948 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FLT1P17948 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FLT1P17948 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FLT1P17948 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FLT1P17948 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FLT1P17948 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FLT1P17948 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FLT1P17948 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FLT1P17948 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FLT1P17948 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
FLT1P17948 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FLT1P17948 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FLT1P17948 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FLT1P17948 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FLT1P17948 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FLT1P17948 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FLT1P17948 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FLT1P17948 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FLT1P17948 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FLT1P17948 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FLT1P17948 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FLT1P17948 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
FLT1P17948 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FLT1P17948 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
FLT1P17948 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FLT1P17948 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FLT1P17948 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FLT1P17948 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
FLT1P17948 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
FLT1P17948 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FLT1P17948 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FLT1P17948 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FLT1P17948 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FLT1P17948 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FLT1P17948 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FLT1P17948 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FLT1P17948 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FLT1P17948 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FLT1P17948 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FLT1P17948 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FLT1P17948 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FLT1P17948 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FLT1P17948 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FLT1P17948 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FLT1P17948 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FLT1P17948 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FLT1P17948 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
FLT1P17948 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
FLT1P17948 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FLT1P17948 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FLT1P17948 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FLT1P17948 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FLT1P17948 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FLT1P17948 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FLT1P17948 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FLT1P17948 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FLT1P17948 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
FLT1P17948 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
FLT1P17948 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
FLT1P17948 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
FLT1P17948 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FLT1P17948 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FLT1P17948 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FLT1P17948 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FLT1P17948 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FLT1P17948 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FLT1P17948 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FLT1P17948 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FLT1P17948 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FLT1P17948 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FLT1P17948 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FLT1P17948 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms