Protein–RNA interactions for Protein: P17481

HOXB8, Homeobox protein Hox-B8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB8P17481 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXB8P17481 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXB8P17481 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms