Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTLA4P16410 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTLA4P16410 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTLA4P16410 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTLA4P16410 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTLA4P16410 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTLA4P16410 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CTLA4P16410 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTLA4P16410 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTLA4P16410 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTLA4P16410 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTLA4P16410 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTLA4P16410 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTLA4P16410 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CTLA4P16410 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTLA4P16410 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTLA4P16410 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTLA4P16410 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTLA4P16410 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTLA4P16410 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTLA4P16410 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTLA4P16410 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTLA4P16410 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTLA4P16410 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CTLA4P16410 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTLA4P16410 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTLA4P16410 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTLA4P16410 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTLA4P16410 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTLA4P16410 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTLA4P16410 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTLA4P16410 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTLA4P16410 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTLA4P16410 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTLA4P16410 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTLA4P16410 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTLA4P16410 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTLA4P16410 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTLA4P16410 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTLA4P16410 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTLA4P16410 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTLA4P16410 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CTLA4P16410 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTLA4P16410 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTLA4P16410 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTLA4P16410 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTLA4P16410 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTLA4P16410 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTLA4P16410 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CTLA4P16410 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CTLA4P16410 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTLA4P16410 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTLA4P16410 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTLA4P16410 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTLA4P16410 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTLA4P16410 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTLA4P16410 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTLA4P16410 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTLA4P16410 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTLA4P16410 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CTLA4P16410 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTLA4P16410 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTLA4P16410 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTLA4P16410 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTLA4P16410 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CTLA4P16410 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTLA4P16410 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CTLA4P16410 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTLA4P16410 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTLA4P16410 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTLA4P16410 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTLA4P16410 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTLA4P16410 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTLA4P16410 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTLA4P16410 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTLA4P16410 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTLA4P16410 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTLA4P16410 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTLA4P16410 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTLA4P16410 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTLA4P16410 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTLA4P16410 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CTLA4P16410 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTLA4P16410 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CTLA4P16410 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTLA4P16410 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTLA4P16410 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTLA4P16410 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTLA4P16410 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CTLA4P16410 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTLA4P16410 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms