Protein–RNA interactions for Protein: P16383

GCFC2, GC-rich sequence DNA-binding factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCFC2P16383 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCFC2P16383 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCFC2P16383 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCFC2P16383 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCFC2P16383 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GCFC2P16383 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCFC2P16383 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCFC2P16383 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCFC2P16383 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCFC2P16383 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GCFC2P16383 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GCFC2P16383 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCFC2P16383 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCFC2P16383 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCFC2P16383 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GCFC2P16383 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GCFC2P16383 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GCFC2P16383 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GCFC2P16383 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GCFC2P16383 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GCFC2P16383 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GCFC2P16383 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GCFC2P16383 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GCFC2P16383 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GCFC2P16383 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GCFC2P16383 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GCFC2P16383 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GCFC2P16383 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GCFC2P16383 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GCFC2P16383 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GCFC2P16383 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GCFC2P16383 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GCFC2P16383 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GCFC2P16383 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GCFC2P16383 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GCFC2P16383 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GCFC2P16383 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GCFC2P16383 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GCFC2P16383 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GCFC2P16383 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GCFC2P16383 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCFC2P16383 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCFC2P16383 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCFC2P16383 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCFC2P16383 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCFC2P16383 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCFC2P16383 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCFC2P16383 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCFC2P16383 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCFC2P16383 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCFC2P16383 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GCFC2P16383 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GCFC2P16383 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
GCFC2P16383 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GCFC2P16383 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GCFC2P16383 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GCFC2P16383 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GCFC2P16383 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GCFC2P16383 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GCFC2P16383 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GCFC2P16383 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GCFC2P16383 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GCFC2P16383 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GCFC2P16383 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GCFC2P16383 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GCFC2P16383 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GCFC2P16383 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GCFC2P16383 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GCFC2P16383 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GCFC2P16383 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GCFC2P16383 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GCFC2P16383 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GCFC2P16383 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCFC2P16383 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCFC2P16383 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCFC2P16383 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCFC2P16383 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCFC2P16383 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCFC2P16383 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCFC2P16383 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GCFC2P16383 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCFC2P16383 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCFC2P16383 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCFC2P16383 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCFC2P16383 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCFC2P16383 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCFC2P16383 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GCFC2P16383 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GCFC2P16383 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GCFC2P16383 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GCFC2P16383 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GCFC2P16383 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GCFC2P16383 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GCFC2P16383 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GCFC2P16383 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GCFC2P16383 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GCFC2P16383 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GCFC2P16383 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GCFC2P16383 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GCFC2P16383 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms